Protein–RNA interactions for Protein: P01851

T-cell receptor beta-2 chain C region, mousemouse

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Length 173 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01851 Kif13a-201ENSMUST00000056978 6866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Dab2ip-205ENSMUST00000112986 5580 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Fuca2-203ENSMUST00000121465 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Sorbs3-202ENSMUST00000227259 2481 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Limch1-204ENSMUST00000118242 5050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Kdm5c-203ENSMUST00000112588 6449 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.54
P01851 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01851 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01851 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01851 Arhgef39-201ENSMUST00000054538 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01851 Pfkfb3-204ENSMUST00000114844 2107 ntTSL 5 BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01851 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01851 D630014O11Rik-201ENSMUST00000160562 3019 ntTSL 1 (best) BASIC11.65□□□□□ -0.55
P01851 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Zfp862-ps-204ENSMUST00000204484 6065 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Acadl-201ENSMUST00000027153 1916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Gart-201ENSMUST00000023684 3518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Rcan2-202ENSMUST00000044895 3363 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Cacna2d1-201ENSMUST00000039370 3933 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Parp3-202ENSMUST00000112479 2030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Kcnc1-203ENSMUST00000160433 3156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Gpat3-201ENSMUST00000031255 2884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Mynn-202ENSMUST00000192715 5555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 C8g-201ENSMUST00000015227 822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Tmbim6-206ENSMUST00000161250 1148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 AC122371.3-201ENSMUST00000223402 1061 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Fip1l1-201ENSMUST00000080164 4673 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 AL732309.2-201ENSMUST00000228052 3210 ntAPPRIS P1 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Cab39-201ENSMUST00000097666 2369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Chst3-201ENSMUST00000068690 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Cnmd-203ENSMUST00000165835 1362 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Patj-201ENSMUST00000030290 2495 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Vmn1r198-202ENSMUST00000226786 6195 ntAPPRIS P2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Zfp618-202ENSMUST00000064814 2868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Edc3-201ENSMUST00000043990 5708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Tfe3-203ENSMUST00000101695 2989 ntTSL 5 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 B230344G16Rik-201ENSMUST00000180782 2024 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
P01851 Tmub1-203ENSMUST00000115036 1455 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Jmjd8-205ENSMUST00000133595 2265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Prmt2-203ENSMUST00000099572 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Cnn1-201ENSMUST00000001384 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Gorasp1-201ENSMUST00000035099 3906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Zfp384-202ENSMUST00000054553 2451 ntTSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Wnt7b-201ENSMUST00000023015 3371 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Spry2-201ENSMUST00000022709 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Pbrm1-206ENSMUST00000112094 5154 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Dnajc5-201ENSMUST00000072334 6578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 5430400D12Rik-201ENSMUST00000181717 1690 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Bud23-203ENSMUST00000111205 1169 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Stpg3-202ENSMUST00000114363 1234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Egfl7-209ENSMUST00000150404 892 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 2310057J18Rik-201ENSMUST00000015663 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Gas5-210ENSMUST00000159706 557 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Gng2-205ENSMUST00000161247 419 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Gm31256-201ENSMUST00000194705 506 ntBASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 AC158605.1-202ENSMUST00000217860 540 ntTSL 2 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Trex2-201ENSMUST00000033738 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 1700007G11Rik-201ENSMUST00000080333 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Gm36864-203ENSMUST00000223070 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Polg-201ENSMUST00000073889 7837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Tmem30c-202ENSMUST00000119407 1396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Unc5d-201ENSMUST00000168630 9220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
P01851 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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