Protein–RNA interactions for Protein: P01801

Ig heavy chain V-III region J606, mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01801 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Myo18a-210ENSMUST00000130305 5450 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Anapc7-202ENSMUST00000119792 3599 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Tmem51os1-203ENSMUST00000150202 1667 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 F3-201ENSMUST00000029771 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Nek3-202ENSMUST00000110730 2050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 AC164426.2-201ENSMUST00000225993 2492 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Ankfn1-201ENSMUST00000050983 2665 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Esr2-201ENSMUST00000076634 3288 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Smim1-213ENSMUST00000182151 5091 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Mei4-202ENSMUST00000189391 1817 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 AF529169-201ENSMUST00000044491 7202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
P01801 Maml3-201ENSMUST00000118075 5450 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Dip2a-202ENSMUST00000105417 6383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Arhgap20os-204ENSMUST00000152203 2113 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm44414-201ENSMUST00000203660 2109 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Daam2-202ENSMUST00000224595 1926 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Ints13-201ENSMUST00000032427 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Dars2-201ENSMUST00000035430 3619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Fam198a-202ENSMUST00000213773 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Col9a3-201ENSMUST00000103059 2846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Ifi47-201ENSMUST00000046704 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Mast3-203ENSMUST00000211948 4251 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Pik3cd-206ENSMUST00000122059 4832 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Tsku-205ENSMUST00000167405 2597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Samd7-201ENSMUST00000108262 3144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Dnmt3l-205ENSMUST00000138785 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm28386-201ENSMUST00000189147 1849 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 AC087890.1-201ENSMUST00000219321 1823 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Fam71e1-201ENSMUST00000107927 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Dctn6-203ENSMUST00000118811 934 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm20498-202ENSMUST00000164386 1043 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm5869-201ENSMUST00000200248 1257 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Fam168a-206ENSMUST00000208013 1129 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm19208-201ENSMUST00000213861 912 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Tmem108-206ENSMUST00000215136 724 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 AC167013.1-201ENSMUST00000228592 202 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Mirlet7c-2-201ENSMUST00000083674 95 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm6502-202ENSMUST00000097478 1218 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Rec8-201ENSMUST00000002395 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Tbc1d1-202ENSMUST00000101195 5432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm37737-201ENSMUST00000195013 1638 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Ebag9-201ENSMUST00000022964 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 AC154725.1-201ENSMUST00000224826 1961 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Ttc14-201ENSMUST00000099153 9661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Kcnd3-201ENSMUST00000079169 2102 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Prkag2-202ENSMUST00000076306 2838 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Klc2-204ENSMUST00000116563 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Zfp422-202ENSMUST00000079749 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Ak4-202ENSMUST00000106945 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Stk32b-201ENSMUST00000094836 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Rps6ka4-202ENSMUST00000170516 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Rps6ka4-201ENSMUST00000025903 3105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gabpb1-202ENSMUST00000089745 3254 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Gm5466-201ENSMUST00000119395 1890 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
P01801 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 Oprm1-215ENSMUST00000105607 2369 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 Sema3f-204ENSMUST00000192727 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 1600020E01Rik-206ENSMUST00000204663 2007 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 5330426L24Rik-201ENSMUST00000200008 2175 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 Sh2d7-202ENSMUST00000118413 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 Gm3287-205ENSMUST00000228893 1332 ntBASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 Ewsr1-201ENSMUST00000063232 1320 ntTSL 1 (best) BASIC10.12□□□□□ -0.79
P01801 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC10.12□□□□□ -0.79
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