Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Micall1-201ENSMUST00000040320 6701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Fbxo21-206ENSMUST00000202447 3959 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Atp13a2-203ENSMUST00000127833 3882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Eif4g1-202ENSMUST00000073840 5394 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Tspan15-201ENSMUST00000047883 3638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Ccdc60-202ENSMUST00000086483 2168 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Pcdh7-201ENSMUST00000068110 5611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Sema6c-203ENSMUST00000107217 3595 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Plekha2-204ENSMUST00000128715 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Rpl11-201ENSMUST00000102536 833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm11511-201ENSMUST00000118146 540 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm22877-201ENSMUST00000175451 105 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm21859-201ENSMUST00000178424 1045 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Smlr1-201ENSMUST00000179685 669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 1110008E08Rik-202ENSMUST00000183621 723 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Mrnip-201ENSMUST00000020647 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Higd2a-201ENSMUST00000026986 648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Rimkla-201ENSMUST00000049994 4097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm9947-201ENSMUST00000067599 2920 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm45278-201ENSMUST00000209650 2414 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Klc2-202ENSMUST00000113727 2874 ntTSL 5 BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Kif9-204ENSMUST00000198043 2233 ntTSL 1 (best) BASIC11.13□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm43463-201ENSMUST00000195967 1803 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm39377-201ENSMUST00000214587 2533 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Slitrk3-201ENSMUST00000059407 3587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Timm10b-204ENSMUST00000106784 494 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 4930471C06Rik-202ENSMUST00000143070 579 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm8343-201ENSMUST00000182705 994 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 1700025F24Rik-201ENSMUST00000185238 894 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm43050-202ENSMUST00000201152 651 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm34908-201ENSMUST00000207222 569 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm45856-201ENSMUST00000212752 416 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Cinp-204ENSMUST00000221102 536 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 CT025602.2-201ENSMUST00000226553 772 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Orc4-202ENSMUST00000090976 1153 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Aldh3b2-201ENSMUST00000143380 2141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Il1rapl2-202ENSMUST00000113063 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Fmnl2-205ENSMUST00000155586 3939 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Add2-208ENSMUST00000203786 2289 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Slc13a3-201ENSMUST00000029208 3524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Zfp777-201ENSMUST00000095944 3184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Srrm3-204ENSMUST00000144211 3932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm11470-201ENSMUST00000118868 1475 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Adcyap1r1-204ENSMUST00000165857 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Pphln1-204ENSMUST00000165935 3473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Ank-201ENSMUST00000022875 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Smarcb1-202ENSMUST00000121304 1622 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Parg-202ENSMUST00000163350 3374 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Dnaja1-210ENSMUST00000164233 5622 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Ifna2-201ENSMUST00000105147 1032 ntAPPRIS P1 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm13809-201ENSMUST00000117921 597 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm4862-201ENSMUST00000170405 438 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Pfdn6-202ENSMUST00000173363 871 ntTSL 2 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Vmn1r-ps63-201ENSMUST00000174565 989 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm2449-201ENSMUST00000180676 585 ntTSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm5733-201ENSMUST00000190232 939 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm42518-201ENSMUST00000196277 938 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Gm17931-201ENSMUST00000208132 634 ntBASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Mt3-202ENSMUST00000211915 440 ntTSL 3 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 1700011B04Rik-212ENSMUST00000223526 889 ntTSL 5 BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Tbca-201ENSMUST00000046644 559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Tmem25-201ENSMUST00000002100 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.12□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.11□□□□□ -0.63
Col5a1O88207 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.11□□□□□ -0.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms