Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Itfg2-203ENSMUST00000142615 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Dgcr2-203ENSMUST00000117082 2987 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 A630014C17Rik-201ENSMUST00000150973 2984 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Setdb2-205ENSMUST00000161459 2995 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Tfe3-204ENSMUST00000115677 2943 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Tbl1xr1-203ENSMUST00000193734 8237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ugt1a2-201ENSMUST00000049289 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Dppa4-202ENSMUST00000096045 1534 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm44775-201ENSMUST00000207266 1456 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Rhbdl2-202ENSMUST00000106204 1120 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Rbm3-204ENSMUST00000115617 1152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Rpl3-ps1-201ENSMUST00000120557 1210 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Pdlim2-205ENSMUST00000129174 729 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm18827-201ENSMUST00000188341 790 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm28511-201ENSMUST00000191594 450 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Lypd2-201ENSMUST00000023260 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Coq7-202ENSMUST00000098090 1215 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Syt1-202ENSMUST00000105276 4820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Arhgap12-211ENSMUST00000182383 2500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Rrnad1-201ENSMUST00000005016 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Anxa8-201ENSMUST00000022519 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Fktn-204ENSMUST00000221657 6241 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Tppp-201ENSMUST00000022057 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Pank4-202ENSMUST00000070953 2706 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm1995-201ENSMUST00000220838 2602 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm36995-201ENSMUST00000126170 5727 ntTSL 2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Umod-206ENSMUST00000209095 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Adamtsl3-204ENSMUST00000173828 2292 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 2900069G24Rik-201ENSMUST00000192780 1311 ntBASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Pds5b-201ENSMUST00000016569 7417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Slc39a9-204ENSMUST00000217889 2155 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Lnx1O70263 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm44172-201ENSMUST00000203903 1235 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm44772-201ENSMUST00000207623 1191 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Med27-201ENSMUST00000028139 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 St6galnac4-204ENSMUST00000179989 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Sncaip-209ENSMUST00000179625 2568 ntTSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Skp2-203ENSMUST00000190131 1819 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Slc25a24-201ENSMUST00000029477 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Espn-201ENSMUST00000030785 3406 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Mat2b-202ENSMUST00000101347 2053 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Siglecf-203ENSMUST00000122423 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Usp19-210ENSMUST00000193678 4517 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Etfrf1-202ENSMUST00000111719 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Thoc6-203ENSMUST00000115489 1083 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm15738-202ENSMUST00000140892 427 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 1700065D16Rik-203ENSMUST00000189279 393 ntTSL 2 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Tnnt3-201ENSMUST00000074187 1007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Rasgrp4-214ENSMUST00000205027 2717 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Polm-202ENSMUST00000109837 2697 ntTSL 5 BASIC14.51□□□□□ -0.09
Lnx1O70263 Cerk-203ENSMUST00000156546 2162 ntTSL 1 (best) BASIC14.51□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms