Protein–RNA interactions for Protein: O54917

E2f6, Transcription factor E2F6, mousemouse

Predictions only

Length 272 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2f6O54917 Ppp1r18-202ENSMUST00000122899 2743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Trmt61b-202ENSMUST00000137830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 D030068K23Rik-201ENSMUST00000180382 2617 ntTSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm6157-201ENSMUST00000199935 1897 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Thy1-201ENSMUST00000114840 1735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ncoa6-203ENSMUST00000109670 7101 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Haus6-201ENSMUST00000070607 6158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Bdnf-205ENSMUST00000111045 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Prrc2b-202ENSMUST00000069817 10671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Dlk1-202ENSMUST00000109841 879 ntTSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm15479-201ENSMUST00000139309 1133 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm42550-201ENSMUST00000201553 960 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Hoxb9-202ENSMUST00000174042 2269 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Cyp2ab1-205ENSMUST00000182741 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Dnajb4-201ENSMUST00000029669 1497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 C2-201ENSMUST00000025230 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Adamts14-202ENSMUST00000120336 3645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm13093-201ENSMUST00000126212 2485 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Olfr279-203ENSMUST00000216822 5605 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ccdc106-202ENSMUST00000108571 1318 ntTSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Foxn4-201ENSMUST00000044790 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Fuca2-201ENSMUST00000060212 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.32□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Sspn-201ENSMUST00000032383 4431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tmcc3os-201ENSMUST00000146744 2912 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gabpb1-206ENSMUST00000110425 4153 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm13848-202ENSMUST00000211663 1560 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Rnf214-208ENSMUST00000161187 2847 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Lrrn1-201ENSMUST00000049285 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Derl2-202ENSMUST00000108523 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Crip3-202ENSMUST00000113465 1035 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 AC166051.1-201ENSMUST00000214313 210 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Epo-201ENSMUST00000031723 715 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pxylp1-201ENSMUST00000078478 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tspan32-205ENSMUST00000105924 1478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tmc4-202ENSMUST00000121743 2204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Spns3-202ENSMUST00000092940 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Nek5-202ENSMUST00000209656 2253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ighg1-202ENSMUST00000194304 2482 ntAPPRIS P5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pogk-202ENSMUST00000128861 4848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Orc5-201ENSMUST00000030872 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tacc2-201ENSMUST00000033141 3940 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Csnk1e-202ENSMUST00000120859 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Fam71f1-204ENSMUST00000166462 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Trim55-201ENSMUST00000029139 2595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Zfp335-201ENSMUST00000041361 4587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tdrd9-201ENSMUST00000079009 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tbl1xr1-211ENSMUST00000202747 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Sod2-201ENSMUST00000007012 3824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Rbm4-206ENSMUST00000180248 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 4732414G09Rik-201ENSMUST00000156243 2422 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Asl-203ENSMUST00000160129 2413 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Ash2l-210ENSMUST00000166078 2234 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Fcer2a-201ENSMUST00000005678 2242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Wdr26-208ENSMUST00000162963 6452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Rspry1-201ENSMUST00000060389 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Brwd1-204ENSMUST00000113829 9843 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Gm19692-201ENSMUST00000203856 2084 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Alox5-202ENSMUST00000164547 1854 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
E2f6O54917 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 44.2 ms