Protein–RNA interactions for Protein: O54693

Eda, Ectodysplasin-A, mousemouse

Predictions only

Length 391 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EdaO54693 Mrps30-201ENSMUST00000022245 3319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Pkdrej-201ENSMUST00000064370 7058 ntAPPRIS P1 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gm44094-201ENSMUST00000204703 2030 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Kcnt1-204ENSMUST00000114176 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Csrnp1-201ENSMUST00000035101 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Strada-202ENSMUST00000103072 1517 ntTSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Cnppd1-201ENSMUST00000041213 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Bcl2l1-201ENSMUST00000007803 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 5730409E04Rik-202ENSMUST00000164362 2855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Ncbp1-201ENSMUST00000030014 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.16□□□□□ -0.46
EdaO54693 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Pdpk1-204ENSMUST00000115409 4623 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Slc19a2-201ENSMUST00000044021 3571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Tubb4b-ps2-201ENSMUST00000187481 1337 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Rubcn-203ENSMUST00000115105 5255 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Rnf185-201ENSMUST00000064364 2906 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Orc3-201ENSMUST00000048706 2300 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Mbp-205ENSMUST00000091789 4797 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Zfp583-201ENSMUST00000062765 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Smc5-202ENSMUST00000223934 3448 ntAPPRIS P2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gm22133-201ENSMUST00000102082 109 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gm11941-201ENSMUST00000119904 610 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Rpl28-ps1-201ENSMUST00000121497 414 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 4930595D18Rik-201ENSMUST00000121608 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gm14965-201ENSMUST00000124118 565 ntTSL 2 BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Adgrv1-205ENSMUST00000126444 3823 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gm10051-201ENSMUST00000145209 414 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Sh2d6-203ENSMUST00000159877 1210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Sh2d6-206ENSMUST00000162561 1251 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Cthrc1-201ENSMUST00000067072 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gm9996-201ENSMUST00000070359 913 ntBASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Sftpd-201ENSMUST00000077136 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Olfr1250-201ENSMUST00000099768 1139 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Chst15-201ENSMUST00000077472 5041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Tnk2-201ENSMUST00000115120 2794 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Cwc27-201ENSMUST00000022228 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Rasa3-201ENSMUST00000117551 4404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Rbm47-206ENSMUST00000200775 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Gm5580-201ENSMUST00000122096 1362 ntAPPRIS P1 BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Fcna-201ENSMUST00000028307 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Fnbp1-206ENSMUST00000113555 1776 ntTSL 5 BASIC12.15□□□□□ -0.46
EdaO54693 Mta2-201ENSMUST00000096240 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm45740-201ENSMUST00000212103 2003 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
EdaO54693 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC12.15□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm44999-201ENSMUST00000207456 1493 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Sephs1-201ENSMUST00000027973 5319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gli2-201ENSMUST00000062483 6637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Cacng3-201ENSMUST00000084615 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Proser1-201ENSMUST00000058577 4472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Pde4d-220ENSMUST00000177907 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Rbpjl-201ENSMUST00000017151 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gtf3c5-201ENSMUST00000028157 2739 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm14752-201ENSMUST00000120719 2075 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Wdr31-201ENSMUST00000030087 1440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm26651-201ENSMUST00000181851 2325 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Leo1-201ENSMUST00000048937 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Psg23-201ENSMUST00000057810 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Ighv1-61-201ENSMUST00000103531 351 ntAPPRIS P1 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Tcf7l2-205ENSMUST00000111651 1127 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Wdr45-206ENSMUST00000116634 1250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm12501-201ENSMUST00000119163 529 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm12029-201ENSMUST00000120073 832 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Omt2a-203ENSMUST00000166056 1167 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm28215-201ENSMUST00000186146 346 ntTSL 5 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 AC154252.2-201ENSMUST00000223593 767 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Gm1821-202ENSMUST00000227415 750 ntBASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Plp2-201ENSMUST00000033486 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 A530020G20Rik-202ENSMUST00000181070 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Rhot1-204ENSMUST00000092857 3687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Prkca-202ENSMUST00000100302 2265 ntTSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
EdaO54693 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.14□□□□□ -0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.8 ms