Protein–RNA interactions for Protein: O35740

Cited2, Cbp/p300-interacting transactivator 2, mousemouse

Predictions only

Length 269 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cited2O35740 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Stambp-ps1-201ENSMUST00000209280 1208 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Trem3-201ENSMUST00000048065 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Abra-201ENSMUST00000054742 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Olfr1368-201ENSMUST00000055298 1064 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 4930442H23Rik-201ENSMUST00000056086 1245 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ccdc71-201ENSMUST00000061209 3092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 1500011B03Rik-201ENSMUST00000061251 579 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Oprm1-205ENSMUST00000078634 1695 ntTSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gpr31b-201ENSMUST00000091648 960 ntAPPRIS P1 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Evi5l-203ENSMUST00000176149 3938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Sdc1-201ENSMUST00000020911 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm36957-201ENSMUST00000192982 2824 ntBASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tmem130-201ENSMUST00000061446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Fgd3-203ENSMUST00000110087 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Ngly1-207ENSMUST00000224656 2329 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Vezf1-201ENSMUST00000018521 4583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Psd2-205ENSMUST00000176873 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Cdc37l1-208ENSMUST00000225310 4079 ntAPPRIS ALT2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Apol6-201ENSMUST00000127957 2034 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm13848-201ENSMUST00000130777 2047 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mlkl-202ENSMUST00000120432 1976 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Emc3-201ENSMUST00000032425 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gpd2-207ENSMUST00000169687 5745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Bag6-203ENSMUST00000172571 3599 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 4931440F15Rik-201ENSMUST00000104962 3274 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 6030458C11Rik-202ENSMUST00000227299 3206 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Kiss1r-201ENSMUST00000045529 3163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Clvs2-204ENSMUST00000161692 4283 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm36445-201ENSMUST00000209344 1432 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Akr1d1-201ENSMUST00000040987 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Trav4d-3-201ENSMUST00000103592 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Trav4d-4-201ENSMUST00000103600 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Trav4n-3-201ENSMUST00000103618 331 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Trav4n-4-201ENSMUST00000103627 354 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Trav4-3-201ENSMUST00000103655 411 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Trav4-4-dv10-201ENSMUST00000103663 361 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Nipsnap3b-202ENSMUST00000107665 848 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Dctn6-202ENSMUST00000117243 962 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm14704-201ENSMUST00000120300 874 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Fhit-206ENSMUST00000162278 981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm27230-202ENSMUST00000184671 857 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm19931-201ENSMUST00000198920 368 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm45865-201ENSMUST00000211815 945 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm7046-201ENSMUST00000221351 977 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Taf1d-201ENSMUST00000034415 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Olfr223-201ENSMUST00000061293 1111 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Vmn1r213-201ENSMUST00000076897 1155 ntAPPRIS P2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm5773-201ENSMUST00000090853 1143 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Slc2a4-201ENSMUST00000018710 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Fmo1-201ENSMUST00000046049 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 S100pbp-205ENSMUST00000117350 2241 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Qrich2-201ENSMUST00000093909 2156 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pianp-207ENSMUST00000162170 2053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Igsf9-201ENSMUST00000052629 4133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm9754-201ENSMUST00000031305 3004 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Necab1-201ENSMUST00000041606 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Dcun1d3-206ENSMUST00000207233 2917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Agpat4-201ENSMUST00000024594 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Nr3c1-203ENSMUST00000115567 6436 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gsdmd-201ENSMUST00000023238 1776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Kif28-202ENSMUST00000211943 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Adipor2-202ENSMUST00000169744 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm4297-201ENSMUST00000119285 2579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Hdac5-201ENSMUST00000008999 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Chrdl1-202ENSMUST00000074660 4096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Pianp-206ENSMUST00000162000 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Gm36745-201ENSMUST00000213455 1594 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Mtf1-202ENSMUST00000106193 7554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Otop2-202ENSMUST00000106544 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 Hcrtr1-203ENSMUST00000120154 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Cited2O35740 4731419I09Rik-201ENSMUST00000180791 2820 ntTSL 2 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.5 ms