Protein–RNA interactions for Protein: O35245

Pkd2, Polycystin-2, mousemouse

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Length 966 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pkd2O35245 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Dll1-201ENSMUST00000014917 3581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Mtm1-203ENSMUST00000061970 3379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Fgfr3-211ENSMUST00000171509 4020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Malt1-202ENSMUST00000224056 4028 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Acap1-201ENSMUST00000001631 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Tpm3-rs7-201ENSMUST00000072359 2147 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Ndel1-202ENSMUST00000101017 1646 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Arhgap22-202ENSMUST00000111956 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Styxl1-205ENSMUST00000111164 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Mir5132-201ENSMUST00000175166 71 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm28450-201ENSMUST00000187349 638 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm31793-201ENSMUST00000218557 415 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Olfr117-201ENSMUST00000073636 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Olfr130-201ENSMUST00000087129 954 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Secisbp2-201ENSMUST00000040117 3328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Art3-201ENSMUST00000113083 1561 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Tnpo2-202ENSMUST00000166592 4884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
Pkd2O35245 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 9030407P20Rik-201ENSMUST00000180933 2310 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Ptk2-201ENSMUST00000110036 4184 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Dgkg-201ENSMUST00000023578 2725 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Polr2a-202ENSMUST00000071213 5799 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Slc2a4-203ENSMUST00000141837 1776 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Exosc1-202ENSMUST00000112123 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Myc-205ENSMUST00000161976 2338 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Myc-201ENSMUST00000022971 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Ighv1-80-201ENSMUST00000103547 351 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Hmgn1-202ENSMUST00000133885 261 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gm11379-201ENSMUST00000154678 381 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gm17040-201ENSMUST00000168672 548 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Atp10d-206ENSMUST00000169617 761 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gm17087-201ENSMUST00000184183 471 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Washc3-201ENSMUST00000020248 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Rpl10a-ps2-201ENSMUST00000071184 642 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Ccnk-201ENSMUST00000101055 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Acap2-201ENSMUST00000058033 6493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Exog-201ENSMUST00000035094 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Evc2-201ENSMUST00000056365 4091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Cbarp-214ENSMUST00000169546 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Ppp4r3b-202ENSMUST00000102856 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Ccdc8-201ENSMUST00000094805 4809 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Rassf8-201ENSMUST00000032388 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Spatc1l-201ENSMUST00000009259 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Csrnp3-202ENSMUST00000112394 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Etv3-202ENSMUST00000119109 5309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gm10767-202ENSMUST00000168767 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Tbc1d22a-201ENSMUST00000063414 3229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gng7-205ENSMUST00000118465 875 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Dnajb6-202ENSMUST00000012734 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gm45339-201ENSMUST00000210823 877 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 4930569F06Rik-201ENSMUST00000036821 433 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Phpt1-201ENSMUST00000039156 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Zfp957-202ENSMUST00000161649 2751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Hdgfl2-210ENSMUST00000225843 2238 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 1700030J22Rik-202ENSMUST00000213068 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Mfsd4a-204ENSMUST00000126927 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Ccr6-203ENSMUST00000166348 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Mb21d1-201ENSMUST00000034898 3231 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Abcb6-201ENSMUST00000027396 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Myl4-202ENSMUST00000106956 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Prr15l-203ENSMUST00000107633 930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Spata3-211ENSMUST00000159876 760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 1700121N20Rik-201ENSMUST00000167922 1027 ntTSL 1 (best) BASIC17.74■□□□□ 0.43
Pkd2O35245 Mir5120-201ENSMUST00000175020 78 ntBASIC17.74■□□□□ 0.43
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