Protein–RNA interactions for Protein: O35111

Kcnk3, Potassium channel subfamily K member 3, mousemouse

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Length 409 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnk3O35111 Rnps1-202ENSMUST00000115371 1617 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm12859-201ENSMUST00000117834 427 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm11478-201ENSMUST00000117851 599 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Crybb3-205ENSMUST00000120506 804 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm23984-201ENSMUST00000157139 203 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm6218-201ENSMUST00000219812 628 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Nsmce1-201ENSMUST00000033006 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Lcn10-201ENSMUST00000058912 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rpl13a-ps1-201ENSMUST00000071866 612 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Prr36-201ENSMUST00000168386 4616 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Zfp629-201ENSMUST00000058038 6120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Zfp710-202ENSMUST00000164056 5871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rims2-202ENSMUST00000082054 4800 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Zfp236-202ENSMUST00000182122 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Bms1-201ENSMUST00000032237 4345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Pbrm1-208ENSMUST00000112098 6566 ntTSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Marco-201ENSMUST00000027639 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 AI464131-201ENSMUST00000054920 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rph3a-201ENSMUST00000079204 4150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Zmat1-202ENSMUST00000113185 3378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gtf2h4-207ENSMUST00000160734 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Mrpl50-201ENSMUST00000057829 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC10.6□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Cep250-204ENSMUST00000109619 7977 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Lepr-203ENSMUST00000106921 5542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm11978-202ENSMUST00000127510 1303 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Atp6v0a1-210ENSMUST00000168757 3967 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Cry2-201ENSMUST00000090559 3976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rbm47-202ENSMUST00000094757 4643 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rac1-201ENSMUST00000080537 4159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Fry-201ENSMUST00000087204 10893 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Sgce-207ENSMUST00000126151 1522 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Ptgfr-201ENSMUST00000029670 6624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Ubxn10-203ENSMUST00000105811 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Lysmd1-201ENSMUST00000066386 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Mir686-201ENSMUST00000102174 109 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm11978-201ENSMUST00000122315 466 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm12454-201ENSMUST00000139119 978 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Kctd18-210ENSMUST00000164963 2114 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm15494-202ENSMUST00000171665 451 ntTSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Gm26894-201ENSMUST00000180828 1134 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Fcrl1-204ENSMUST00000191666 925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 1700020A23Rik-201ENSMUST00000028898 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Myo18a-222ENSMUST00000168348 6582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Smad4-202ENSMUST00000114939 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 Nrg1-206ENSMUST00000208205 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Kcnk3O35111 Scaf4-202ENSMUST00000163419 4169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Arhgap1-202ENSMUST00000111329 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Nkd2-201ENSMUST00000022051 4016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Zfp654-202ENSMUST00000207826 6261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 CT025678.1-201ENSMUST00000214795 2972 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Eif4g1-217ENSMUST00000143939 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Rgs6-222ENSMUST00000202210 3069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Ercc2-202ENSMUST00000108460 3485 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.71
Kcnk3O35111 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Mirt1-202ENSMUST00000180667 1633 ntTSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Fsd1-201ENSMUST00000011733 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Myh13-203ENSMUST00000180845 5991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Pdhx-201ENSMUST00000011058 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Mzf1-205ENSMUST00000182515 3340 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Sin3b-201ENSMUST00000004494 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Nedd9-202ENSMUST00000163623 4626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Son-203ENSMUST00000117633 8731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Gpr176-201ENSMUST00000039160 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Tmem178b-201ENSMUST00000061740 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Gm44831-201ENSMUST00000208469 2989 ntBASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Kcnk3O35111 Cyp8b1-201ENSMUST00000062474 1950 ntAPPRIS P1 BASIC10.58□□□□□ -0.72
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.8 ms