Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Gm38037-201ENSMUST00000192600 1624 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Smc4-201ENSMUST00000042901 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 E130308A19Rik-201ENSMUST00000052420 3205 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Peg10-202ENSMUST00000176204 6667 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Rhog-202ENSMUST00000106923 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gja5-203ENSMUST00000199597 3668 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Extl3-201ENSMUST00000022550 5977 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Usp53-202ENSMUST00000197314 3586 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Nudt1-203ENSMUST00000110825 599 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm12928-201ENSMUST00000117115 573 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Calhm3-201ENSMUST00000178630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm7287-201ENSMUST00000205267 602 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm17870-201ENSMUST00000219489 1174 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gemin7-201ENSMUST00000051364 763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Rnaseh2a-210ENSMUST00000147812 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Egr1-202ENSMUST00000165033 3036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm5779-202ENSMUST00000219564 1477 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Olfr177-202ENSMUST00000217377 2401 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm37269-201ENSMUST00000193906 1891 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm10097-201ENSMUST00000180100 2784 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Fosb-202ENSMUST00000207334 3664 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Sept10-201ENSMUST00000165971 2532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Hdac6-201ENSMUST00000033501 4142 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Cacna1c-212ENSMUST00000187940 7507 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm26846-201ENSMUST00000181865 4869 ntTSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Pex5-204ENSMUST00000112531 3075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ctsl-201ENSMUST00000021933 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ctsk-201ENSMUST00000015664 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Robo1-201ENSMUST00000023600 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm38385-201ENSMUST00000194454 2351 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Dtnb-201ENSMUST00000077930 2376 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm11732-201ENSMUST00000151381 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Akap10-202ENSMUST00000102650 3874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Htr2c-203ENSMUST00000112831 809 ntTSL 3 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm5940-201ENSMUST00000117582 1068 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Myl10-204ENSMUST00000197186 607 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm19817-201ENSMUST00000199764 2132 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm19710-201ENSMUST00000200257 640 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm6013-201ENSMUST00000212264 699 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ccdc159-204ENSMUST00000216710 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Pomc-202ENSMUST00000218089 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Mal-201ENSMUST00000028853 486 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm7399-201ENSMUST00000032395 858 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Eef2k-201ENSMUST00000047875 6580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Asap3-201ENSMUST00000047526 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Rapgef3-205ENSMUST00000129223 3750 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Pglyrp2-202ENSMUST00000170392 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ugt1a6a-201ENSMUST00000014263 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Myom3-201ENSMUST00000105854 5575 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ralbp1-202ENSMUST00000166543 4089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Eya1-202ENSMUST00000080664 3426 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Hdac7-201ENSMUST00000079838 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Cyth1-204ENSMUST00000106305 3179 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Abo-201ENSMUST00000102900 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Riox2-203ENSMUST00000120674 1753 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Gm10392-201ENSMUST00000100807 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 AC160411.1-201ENSMUST00000218544 4560 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ralgps2-211ENSMUST00000190648 2498 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Hp-201ENSMUST00000074898 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Rimbp2-204ENSMUST00000198941 6446 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Ccdc81-201ENSMUST00000041195 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Neil1-203ENSMUST00000190245 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Serpinb12-201ENSMUST00000081277 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Nexmif-203ENSMUST00000118314 11476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Hps1O08983 Fzr1-202ENSMUST00000118812 1215 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
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