Protein–RNA interactions for Protein: O08540

Msmb, Beta-microseminoprotein, mousemouse

Predictions only

Length 113 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MsmbO08540 Gm2546-201ENSMUST00000182630 991 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm4691-202ENSMUST00000182989 885 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm43758-201ENSMUST00000199500 367 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 AC155813.1-201ENSMUST00000213224 590 ntTSL 3 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 1700023F06Rik-201ENSMUST00000021323 1199 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mea1-201ENSMUST00000002845 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Asb9-201ENSMUST00000033756 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Polr2e-201ENSMUST00000004786 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Asb8-201ENSMUST00000059112 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm42840-201ENSMUST00000200303 2251 ntBASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Eps8l3-201ENSMUST00000037375 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Hvcn1-201ENSMUST00000072602 2790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 5031415H12Rik-201ENSMUST00000181546 2481 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Slc30a3-206ENSMUST00000202740 1989 ntTSL 5 BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Spag1-201ENSMUST00000047348 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Poc1b-201ENSMUST00000020113 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tmeff2-201ENSMUST00000081851 3343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Rnf182-201ENSMUST00000059986 3544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.64□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gulp1-203ENSMUST00000160854 1399 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Erg-201ENSMUST00000077773 2232 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 E230020A03Rik-201ENSMUST00000194646 2386 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cadm2-202ENSMUST00000120594 3248 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Styxl1-202ENSMUST00000111161 963 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Rhox2g-201ENSMUST00000115169 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm13394-201ENSMUST00000121658 1000 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm14230-202ENSMUST00000137463 874 ntTSL 2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm44405-201ENSMUST00000198952 126 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm45022-201ENSMUST00000208332 545 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 AC112680.3-201ENSMUST00000215297 488 ntTSL 3 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 AC162938.2-203ENSMUST00000216604 1134 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Prss39-201ENSMUST00000027299 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Mecom-202ENSMUST00000108270 5692 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Fnbp1-203ENSMUST00000100207 1680 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Myo7a-204ENSMUST00000107128 7506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 A530072M11Rik-201ENSMUST00000151122 1852 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Sema4a-213ENSMUST00000165898 3125 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Slc7a7-206ENSMUST00000197440 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Pygm-201ENSMUST00000035269 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Syt16-203ENSMUST00000221220 8156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Itgb4-204ENSMUST00000106460 5919 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ubap2l-202ENSMUST00000064639 4073 ntTSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ssr1-203ENSMUST00000225246 1825 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Wdr17-211ENSMUST00000175915 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Cdc37l1-207ENSMUST00000225210 4163 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Odf2-201ENSMUST00000028128 2376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Nox3-201ENSMUST00000115800 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Insrr-201ENSMUST00000029711 5102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.63□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm28551-201ENSMUST00000144660 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Colgalt2-201ENSMUST00000044311 4093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Lrrc8c-201ENSMUST00000067924 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Gm38100-201ENSMUST00000194391 1329 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Oprm1-202ENSMUST00000052751 1334 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Oprm1-207ENSMUST00000092731 1332 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Jmjd8-201ENSMUST00000026832 2091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Dnaaf1-201ENSMUST00000093100 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Sptbn2-201ENSMUST00000008991 8251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
MsmbO08540 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC9.62□□□□□ -0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.5 ms