Protein–RNA interactions for Protein: J3QPX5

Gm8888, Predicted gene 8888, mousemouse

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Length 126 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8888J3QPX5 Map3k11-201ENSMUST00000004156 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Rara-201ENSMUST00000068133 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gtf2ird1-202ENSMUST00000074114 3330 ntTSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm26678-201ENSMUST00000181057 3025 ntTSL 5 BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gpr26-201ENSMUST00000045840 11571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.22□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Rbm48-201ENSMUST00000042753 2368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Them4-201ENSMUST00000049822 1781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Bach2-201ENSMUST00000037416 3462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gfra1-203ENSMUST00000129100 4415 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Cdc7-203ENSMUST00000117196 2864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Jph2-202ENSMUST00000109425 4155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Cdk13-207ENSMUST00000223490 12548 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Med28-203ENSMUST00000119579 636 ntTSL 3 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Rpsa-ps9-201ENSMUST00000120702 885 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Rmrp-201ENSMUST00000157463 271 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Cabp2-202ENSMUST00000159556 781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 1700065I16Rik-202ENSMUST00000185477 813 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Reep1-202ENSMUST00000212631 953 ntTSL 5 BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm32635-201ENSMUST00000221493 1162 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 AL732506.1-201ENSMUST00000226420 281 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Gm6091-201ENSMUST00000098307 165 ntBASIC11.21□□□□□ -0.61
Gm8888J3QPX5 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Heatr3-202ENSMUST00000121949 3086 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Fndc3b-201ENSMUST00000046157 6875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Psmd9-201ENSMUST00000100729 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Aire-216ENSMUST00000156417 1627 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Drc3-202ENSMUST00000094140 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Chchd3-201ENSMUST00000066379 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Cers6-201ENSMUST00000028426 7038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Frmd4a-202ENSMUST00000091497 6208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Ttpa-203ENSMUST00000121491 2862 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Nab1-204ENSMUST00000170269 1371 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Coq3-201ENSMUST00000029909 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Dolpp1-202ENSMUST00000113612 1958 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Klhl8-202ENSMUST00000112811 2577 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Slc25a45-202ENSMUST00000125114 2599 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Actb-201ENSMUST00000100497 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Mecp2-204ENSMUST00000140399 1168 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
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Gm8888J3QPX5 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Utp23-201ENSMUST00000059599 740 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Med8-203ENSMUST00000084319 1134 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Pde1c-209ENSMUST00000203372 3147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Tspan32-202ENSMUST00000075172 1876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Kansl3-201ENSMUST00000010597 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Ebp-201ENSMUST00000033509 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Arhgap31-201ENSMUST00000023487 7964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Stau1-201ENSMUST00000049412 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Dpp9-201ENSMUST00000038794 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Arap1-202ENSMUST00000084896 4926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Gm7224-201ENSMUST00000121359 2066 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Tbata-201ENSMUST00000035894 1506 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 2810403A07Rik-201ENSMUST00000029696 2981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Wfs1-201ENSMUST00000043964 3787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 BC024139-201ENSMUST00000054022 2623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Alkbh2-202ENSMUST00000112279 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Gm8888J3QPX5 Gm12678-201ENSMUST00000154177 692 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
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