Protein–RNA interactions for Protein: J3QMY9

Top6bl, Type 2 DNA topoisomerase 6 subunit B-like, mousemouse

Predictions only

Length 579 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Top6blJ3QMY9 Olfr1413-201ENSMUST00000074859 1082 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Trpt1-201ENSMUST00000088223 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Vmn1r197-201ENSMUST00000091734 897 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Golim4-202ENSMUST00000117242 4551 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm13142-201ENSMUST00000117213 1453 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Hsph1-201ENSMUST00000074846 3240 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Akt1-205ENSMUST00000128300 1342 ntTSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Sgf29-201ENSMUST00000032956 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Atp9a-201ENSMUST00000029060 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Cacna2d1-202ENSMUST00000078272 7311 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Etfrf1-207ENSMUST00000111726 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Slc3a2-207ENSMUST00000206598 1393 ntTSL 2 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Pdcd1-201ENSMUST00000027507 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Styxl1-201ENSMUST00000053906 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Fig4-201ENSMUST00000043814 3282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm26531-201ENSMUST00000181727 1967 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm17435-202ENSMUST00000212699 1998 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gas7-201ENSMUST00000041611 2968 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Sall3-201ENSMUST00000057950 6886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Dnm2-206ENSMUST00000172482 2613 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Tnnt3-217ENSMUST00000105957 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Tmod4-202ENSMUST00000107227 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 1700003G18Rik-201ENSMUST00000140689 633 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm17376-201ENSMUST00000166016 84 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 S100a14-202ENSMUST00000167598 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ighv1-62-201ENSMUST00000193406 350 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Pcbd1-201ENSMUST00000020298 789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm18615-201ENSMUST00000222919 1031 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 1110017D15Rik-201ENSMUST00000030152 1114 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Prss34-201ENSMUST00000037453 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Cyp2j13-203ENSMUST00000107078 1493 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Sfxn3-203ENSMUST00000111954 2867 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Zbtb7b-203ENSMUST00000107433 3650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Arid3a-201ENSMUST00000019708 5361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Adcyap1r1-203ENSMUST00000165786 1745 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Sh3bp4-201ENSMUST00000066279 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gzf1-201ENSMUST00000028928 4232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Pkp1-201ENSMUST00000027667 4669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Bcas3-201ENSMUST00000074875 2814 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Dnpep-202ENSMUST00000113605 1571 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Rnls-202ENSMUST00000163093 1378 ntTSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ppp1r9b-202ENSMUST00000107748 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.07□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Cyth1-201ENSMUST00000017276 3135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Eef1akmt3-201ENSMUST00000116231 2719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Asl-202ENSMUST00000159619 2088 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm44758-201ENSMUST00000206096 2068 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Bcl2-201ENSMUST00000112751 7191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Usp2-201ENSMUST00000034508 3867 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Twistnb-201ENSMUST00000020877 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Celf1-202ENSMUST00000068726 7851 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Zfp41-201ENSMUST00000054555 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Orc2-201ENSMUST00000027198 3561 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm24934-201ENSMUST00000103764 111 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Prr29-202ENSMUST00000106816 771 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm14109-201ENSMUST00000118814 309 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm13391-202ENSMUST00000147685 816 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Asb17os-201ENSMUST00000156292 496 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm20470-201ENSMUST00000174654 331 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm20636-201ENSMUST00000176660 707 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm26740-201ENSMUST00000180456 358 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm28192-201ENSMUST00000189381 778 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 AC166344.1-202ENSMUST00000224139 234 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Fxyd1-202ENSMUST00000071697 522 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Igf1-204ENSMUST00000121161 1344 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Fam110a-203ENSMUST00000109864 1591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ggt6-201ENSMUST00000076443 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Ddr1-204ENSMUST00000119825 3769 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Eef1e1-201ENSMUST00000001757 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Gm44292-201ENSMUST00000205194 2364 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Setdb1-201ENSMUST00000015841 4658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Reep2-201ENSMUST00000043484 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Top6blJ3QMY9 1700088E04Rik-212ENSMUST00000190959 1403 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.1 ms