Protein–RNA interactions for Protein: J3KMS6

Gm21818, MCG122238, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21818J3KMS6 Hs6st2-202ENSMUST00000114871 4351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm11555-202ENSMUST00000104929 638 ntAPPRIS P1 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Plod1-202ENSMUST00000105712 1059 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm16342-201ENSMUST00000124025 1025 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Klhl3-202ENSMUST00000160860 7149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Stk19-ps1-201ENSMUST00000174597 517 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm17634-201ENSMUST00000181383 1285 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm10728-201ENSMUST00000194292 1829 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Psmc3ip-201ENSMUST00000019447 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 C030018K13Rik-202ENSMUST00000196829 712 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm45684-201ENSMUST00000210244 1571 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC157950.1-201ENSMUST00000217561 2168 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 AC159006.1-201ENSMUST00000226396 258 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ifitm3-201ENSMUST00000026565 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 4931409K22Rik-201ENSMUST00000088302 2613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Lig1-201ENSMUST00000098814 3091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
Gm21818J3KMS6 Ambra1-203ENSMUST00000099712 5021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Plekhg5-204ENSMUST00000118648 3818 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rab11fip1-203ENSMUST00000209377 3769 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ophn1-201ENSMUST00000033560 7170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Eif5-212ENSMUST00000222375 3547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rbm12b2-201ENSMUST00000063839 3327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mafk-202ENSMUST00000110836 3097 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ntng1-208ENSMUST00000133268 5587 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Oxnad1-201ENSMUST00000022462 2376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm38569-201ENSMUST00000205476 2228 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rfx1-201ENSMUST00000005600 4172 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Xpot-203ENSMUST00000218004 6005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cnot7-211ENSMUST00000149992 2982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Terb1-201ENSMUST00000064576 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 4931406C07Rik-203ENSMUST00000180339 2756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Setd5-201ENSMUST00000042889 6755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dnmt1-201ENSMUST00000004202 5367 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm12138-201ENSMUST00000122180 951 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm26854-201ENSMUST00000180418 705 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm28198-201ENSMUST00000190938 471 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 2610300A13Rik-201ENSMUST00000192930 503 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm42722-201ENSMUST00000198855 940 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 AC162801.1-201ENSMUST00000220612 198 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Nup37-201ENSMUST00000052355 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cby3-201ENSMUST00000052596 703 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 A730061H03Rik-201ENSMUST00000066106 465 ntAPPRIS P1 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rpl36-201ENSMUST00000080492 404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm26035-201ENSMUST00000083065 308 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Nsd3-208ENSMUST00000146919 3652 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rps6ka6-210ENSMUST00000137712 2410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Tfdp2-205ENSMUST00000179416 2408 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Robo3-201ENSMUST00000034643 4712 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Cd163l1-203ENSMUST00000209398 3437 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Mki67-201ENSMUST00000033310 10061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ift140-201ENSMUST00000024983 5489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dlg4-204ENSMUST00000108589 3271 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gtf2ird1-224ENSMUST00000202280 3052 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Pipox-201ENSMUST00000017597 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Prc1-206ENSMUST00000173824 2912 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Map1b-203ENSMUST00000223725 2669 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Thrb-203ENSMUST00000091471 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gng7-203ENSMUST00000117805 3382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Atp5f1-201ENSMUST00000118209 1604 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Rapgef3-203ENSMUST00000126854 4005 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Fn1-214ENSMUST00000188894 8043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dolpp1-203ENSMUST00000123202 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Dolpp1-201ENSMUST00000028209 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Ildr1-201ENSMUST00000023617 3042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Gm21818J3KMS6 Slc22a13b-ps-201ENSMUST00000173185 1458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.69□□□□□ -0.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.4 ms