Protein–RNA interactions for Protein: H7BX78

Zfp408, Zinc finger protein 408, mousemouse

Predictions only

Length 710 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Zfp408H7BX78 Ibtk-201ENSMUST00000039213 5650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 S1pr1-201ENSMUST00000055676 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 AC159314.1-201ENSMUST00000216917 3485 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gjb2-201ENSMUST00000055698 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Cldn18-204ENSMUST00000136429 1409 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Ppp2r2b-202ENSMUST00000117687 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Mmab-201ENSMUST00000031560 3020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Snap25-202ENSMUST00000110098 1014 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Timm10-202ENSMUST00000111631 564 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm4219-201ENSMUST00000168140 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 C87198-201ENSMUST00000173553 1045 ntTSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Mymx-204ENSMUST00000208801 437 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 AC069562.3-201ENSMUST00000225387 587 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Tmem256-201ENSMUST00000094065 492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Ebf3-203ENSMUST00000168203 3724 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Araf-203ENSMUST00000122312 2854 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Pdxdc1-201ENSMUST00000023361 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm42890-202ENSMUST00000167642 2566 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm43823-201ENSMUST00000197391 1808 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Srr-203ENSMUST00000108448 3239 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Ank2-203ENSMUST00000182008 2474 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Mtus1-202ENSMUST00000059115 6548 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Pdlim5-201ENSMUST00000029941 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Ppp1r18-203ENSMUST00000127442 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Usp24-204ENSMUST00000165709 10594 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Abcc5-202ENSMUST00000079158 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Runx3-201ENSMUST00000056977 3884 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Ptpn2-203ENSMUST00000122412 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Reln-201ENSMUST00000062372 10885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Aknad1-202ENSMUST00000133931 2603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Slc14a1-203ENSMUST00000160639 2047 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Treh-201ENSMUST00000034609 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 4930550C17Rik-201ENSMUST00000181629 1411 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 AC126262.1-201ENSMUST00000221802 1904 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Kpna1-201ENSMUST00000004054 5039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Pole3-201ENSMUST00000030091 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Caln1-201ENSMUST00000086029 1801 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Lsm2-202ENSMUST00000114011 840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Litaf-202ENSMUST00000117360 763 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 6430590A07Rik-201ENSMUST00000181813 1032 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm44170-201ENSMUST00000203181 549 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 AC147241.1-201ENSMUST00000222173 785 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Pcgf1-201ENSMUST00000092614 866 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Slc25a40-201ENSMUST00000066921 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Slc9b1-201ENSMUST00000078568 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Arid3b-209ENSMUST00000171444 4171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 E2f7-201ENSMUST00000073781 5473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Bend3-201ENSMUST00000040147 5882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Bicd1-202ENSMUST00000086829 9667 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 4933436I20Rik-202ENSMUST00000190615 1509 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 H3f3a-205ENSMUST00000161308 2841 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Capn2-201ENSMUST00000068505 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Tsku-207ENSMUST00000206414 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Foxd4-201ENSMUST00000058600 2345 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Mgll-207ENSMUST00000163271 3991 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Cacnb2-203ENSMUST00000114723 3945 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Tns2-202ENSMUST00000169627 4707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm7553-201ENSMUST00000185805 1426 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Ap1g2-211ENSMUST00000170285 2596 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Hgs-201ENSMUST00000026900 2908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Usp3-205ENSMUST00000127569 5607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Scd2-201ENSMUST00000026221 5453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Nudt8-201ENSMUST00000155405 3904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Kcnj5-203ENSMUST00000216033 2440 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Gm26677-201ENSMUST00000180553 1672 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Slc5a11-207ENSMUST00000167299 2022 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Zfp408H7BX78 Rara-207ENSMUST00000164748 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 84.4 ms