Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Kif13b-201ENSMUST00000100473 5603 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm11918-201ENSMUST00000121660 179 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm12984-201ENSMUST00000145711 273 ntTSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm26602-201ENSMUST00000181321 285 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm28911-201ENSMUST00000188837 117 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm34086-201ENSMUST00000196486 743 ntTSL 3 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ociad1-210ENSMUST00000202250 800 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm9794-201ENSMUST00000202370 423 ntBASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 4921530L21Rik-202ENSMUST00000228913 1115 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Fam173b-201ENSMUST00000042702 1164 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ppil3-201ENSMUST00000081677 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Telo2-201ENSMUST00000024987 3434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Grip2-201ENSMUST00000159684 3006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Ephx3-201ENSMUST00000087721 2416 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Runx1-202ENSMUST00000113956 4738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Glipr2-202ENSMUST00000107855 1816 ntTSL 2 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Pkn1-208ENSMUST00000144258 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Tanc2-202ENSMUST00000100330 11855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Camk2d-216ENSMUST00000163226 4204 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.66
Cldn20G5E8X0 Arhgap39-201ENSMUST00000036176 4500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm12132-201ENSMUST00000130945 1391 ntTSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Naga-201ENSMUST00000023088 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Slc37a2-201ENSMUST00000115068 5943 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.9□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Fam206a-201ENSMUST00000045368 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm26747-201ENSMUST00000180597 1716 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Eif1ax-201ENSMUST00000087143 5172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Mapk3-203ENSMUST00000091328 1716 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Klf11-201ENSMUST00000020982 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Clec16a-203ENSMUST00000115823 2643 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Tubgcp2-201ENSMUST00000026547 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Stx17-201ENSMUST00000064765 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Dmp1-201ENSMUST00000066708 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gp2-202ENSMUST00000207887 1853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Igfbp4-201ENSMUST00000017637 3831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Zcchc18-202ENSMUST00000101227 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Sec23a-201ENSMUST00000021375 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm10110-202ENSMUST00000228705 3220 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Lypla1-201ENSMUST00000027036 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Rapsn-202ENSMUST00000111445 1450 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Cacng5-201ENSMUST00000039071 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm11766-201ENSMUST00000143428 3018 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Telo2-202ENSMUST00000115181 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 A430028G04Rik-201ENSMUST00000219095 1973 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Lamp5-201ENSMUST00000057503 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Lamb3-209ENSMUST00000194677 4867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Eogt-202ENSMUST00000113387 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn20G5E8X0 Prss41-202ENSMUST00000122936 1088 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm15755-201ENSMUST00000133698 659 ntTSL 3 BASIC10.89□□□□□ -0.67
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Cldn20G5E8X0 Carmn-202ENSMUST00000182244 988 ntTSL 2 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Letm2-213ENSMUST00000211422 738 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Nme2-201ENSMUST00000021217 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Arhgef33-209ENSMUST00000225223 714 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Emc4-201ENSMUST00000028551 983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Mbtd1-201ENSMUST00000063645 2138 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Rad54l-202ENSMUST00000102705 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Chtop-201ENSMUST00000001043 3257 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm36065-202ENSMUST00000219654 1424 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Col6a3-208ENSMUST00000188587 8285 ntTSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm45496-201ENSMUST00000209918 2917 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 March7-203ENSMUST00000102748 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Slc29a1-213ENSMUST00000167692 2092 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Kdm5c-201ENSMUST00000082177 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Cep97-203ENSMUST00000118500 3389 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 4930428O21Rik-201ENSMUST00000198537 1740 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Sugp1-201ENSMUST00000011450 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Hao1-201ENSMUST00000028704 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Ptprh-201ENSMUST00000049113 3495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Grhl1-202ENSMUST00000085553 3469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Gm45776-201ENSMUST00000212366 1522 ntBASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Rab11a-208ENSMUST00000172298 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Kremen1-201ENSMUST00000020662 4856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
Cldn20G5E8X0 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC10.89□□□□□ -0.67
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