Protein–RNA interactions for Protein: G5E861

Sclt1, Sodium channel and clathrin linker 1, mousemouse

Predictions only

Length 688 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sclt1G5E861 Camsap3-203ENSMUST00000207077 3832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 4930588K23Rik-201ENSMUST00000156827 1963 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Rapgef2-202ENSMUST00000118340 6544 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Dnajc13-201ENSMUST00000035170 8012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Abhd14b-209ENSMUST00000216130 1624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Itpr3-201ENSMUST00000049308 8990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm14243-201ENSMUST00000131401 2172 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm27177-202ENSMUST00000183514 2703 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Pex11b-207ENSMUST00000165842 1562 ntTSL 2 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 9230110C19Rik-201ENSMUST00000065291 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Abca7-202ENSMUST00000132517 6696 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Spatc1l-202ENSMUST00000105414 1060 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Ndufaf2-201ENSMUST00000163558 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 1700037F24Rik-201ENSMUST00000181254 973 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm43818-201ENSMUST00000200605 466 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Ier3-201ENSMUST00000003635 1131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Fgf2-201ENSMUST00000038885 462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Cyb5d1-201ENSMUST00000051620 753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gps2-201ENSMUST00000057884 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm10268-201ENSMUST00000085340 555 ntBASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm9195-201ENSMUST00000208955 8870 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Opcml-201ENSMUST00000073822 2378 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Abcd1-202ENSMUST00000114461 2323 ntTSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Cyb561d1-201ENSMUST00000065664 4058 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gtf2ird1-209ENSMUST00000171794 3524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Frmpd1-202ENSMUST00000107804 5241 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Lef1-204ENSMUST00000106341 3357 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Fgd2-201ENSMUST00000024810 2612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Lef1-202ENSMUST00000066849 3398 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm3764-205ENSMUST00000181134 2203 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Hipk4-201ENSMUST00000037134 2926 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Mtmr10-201ENSMUST00000032736 5205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Ppcs-202ENSMUST00000106316 954 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Pnpo-202ENSMUST00000107629 681 ntTSL 3 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm14760-201ENSMUST00000121831 999 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Sbk3-201ENSMUST00000133272 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm7029-201ENSMUST00000173226 450 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Slc35d2-202ENSMUST00000220792 917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gm9955-201ENSMUST00000067987 309 ntAPPRIS P1 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Tcf4-205ENSMUST00000114980 2192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Acvrl1-205ENSMUST00000120754 3506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Rbms1-201ENSMUST00000028347 4436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Gck-203ENSMUST00000109823 2361 ntTSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.25
Sclt1G5E861 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gabpb1-204ENSMUST00000103227 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC13.46□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tacr2-201ENSMUST00000020278 2258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Capn8-202ENSMUST00000168514 2483 ntTSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tcf25-203ENSMUST00000211932 5002 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Pcdh8-204ENSMUST00000195355 3704 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.46□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Mettl13-201ENSMUST00000028017 4541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm4735-201ENSMUST00000138679 1302 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm5855-201ENSMUST00000200240 1305 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Jade2-203ENSMUST00000109091 6099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Fgf12-201ENSMUST00000100024 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Ska3-201ENSMUST00000022536 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Saxo1-201ENSMUST00000030216 1892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Mrps17-205ENSMUST00000119985 859 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm15703-201ENSMUST00000120250 880 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 U2af1l4-206ENSMUST00000163654 781 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 U2af1l4-221ENSMUST00000167361 860 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Rnf141-207ENSMUST00000176716 1080 ntTSL 2 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Kif2c-201ENSMUST00000065896 2842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gfod2-201ENSMUST00000013294 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Ints1-210ENSMUST00000200393 7070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm13075-202ENSMUST00000149247 1621 ntTSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Uap1l1-201ENSMUST00000102925 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Tspoap1-201ENSMUST00000039627 7616 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Plpbp-201ENSMUST00000033875 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Dock11-201ENSMUST00000033419 6665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.45□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Cacna1c-227ENSMUST00000220022 7765 ntTSL 5 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Sclt1G5E861 Gm9881-201ENSMUST00000068783 3205 ntAPPRIS P1 BASIC13.44□□□□□ -0.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.3 ms