Protein–RNA interactions for Protein: G3XA52

Vmn1r34, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r34G3XA52 Trpv1-201ENSMUST00000006106 2340 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Dppa4-201ENSMUST00000050705 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Prkce-201ENSMUST00000097274 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Lrriq1-203ENSMUST00000166240 5232 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm15198-201ENSMUST00000117283 177 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Rhox7-ps1-201ENSMUST00000117595 806 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm12314-201ENSMUST00000118104 538 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Nfu1-203ENSMUST00000120240 1195 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm11597-201ENSMUST00000121423 964 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm15351-201ENSMUST00000123920 419 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tspan17-208ENSMUST00000163915 459 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm26973-201ENSMUST00000182105 696 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm26956-201ENSMUST00000182176 986 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm27516-201ENSMUST00000184237 98 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Rpl7a-ps2-201ENSMUST00000200554 774 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm3961-201ENSMUST00000204425 994 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Scoc-203ENSMUST00000212031 409 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Mlana-201ENSMUST00000025719 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Riiad1-201ENSMUST00000029785 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Rpl10-201ENSMUST00000008826 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Olfr366-201ENSMUST00000091001 930 ntAPPRIS P1 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tyk2-206ENSMUST00000216874 4828 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Mdm2-202ENSMUST00000105263 3145 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Rnf10-202ENSMUST00000112096 3112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Ccdc30-202ENSMUST00000063642 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Bpifb6-201ENSMUST00000088955 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tmem201-203ENSMUST00000105687 3697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Sipa1l2-204ENSMUST00000212987 6690 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Lrrc29-203ENSMUST00000210412 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pbxip1-201ENSMUST00000038942 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Adh6a-202ENSMUST00000106247 1341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pcnx3-202ENSMUST00000113615 7264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Nup88-203ENSMUST00000108531 2453 ntTSL 1 (best) BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Duox1-201ENSMUST00000099461 5267 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.07□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Igbp1b-201ENSMUST00000054786 1456 ntAPPRIS P1 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Epha5-202ENSMUST00000113398 4830 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm17089-201ENSMUST00000171098 1394 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tars2-201ENSMUST00000029752 2400 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Arhgef10l-202ENSMUST00000069623 4531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 1500009C09Rik-201ENSMUST00000136948 1526 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Psd2-201ENSMUST00000115716 4607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tpm1-207ENSMUST00000113687 962 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm8908-201ENSMUST00000121633 1024 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 1700066O22Rik-203ENSMUST00000150994 961 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm28638-201ENSMUST00000188152 288 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm36937-201ENSMUST00000192957 429 ntTSL 3 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm44364-201ENSMUST00000198368 141 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm43179-201ENSMUST00000198797 275 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 AC166095.1-201ENSMUST00000223731 1241 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tnfrsf17-201ENSMUST00000023140 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Zfp248-205ENSMUST00000161519 2243 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Ubqln1-202ENSMUST00000076454 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Muc6-202ENSMUST00000189314 5087 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Reps2-201ENSMUST00000101102 7630 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Rapgef2-201ENSMUST00000118100 6573 ntTSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Farsb-202ENSMUST00000170217 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 AC164107.1-201ENSMUST00000227730 2161 ntBASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Prss30-201ENSMUST00000024936 1470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Hsd3b3-201ENSMUST00000090743 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Clcn3-201ENSMUST00000004430 4175 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Jarid2-201ENSMUST00000044608 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.06□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Col14a1-201ENSMUST00000023053 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Vrtn-202ENSMUST00000166772 3098 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pdhx-202ENSMUST00000111183 2078 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Wdr53-201ENSMUST00000023474 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Smyd3-202ENSMUST00000111134 1229 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Tmem219-203ENSMUST00000120007 1087 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm13875-201ENSMUST00000120162 282 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gstt1-202ENSMUST00000120177 1105 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Acyp1-204ENSMUST00000121930 634 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Mypopos-201ENSMUST00000124897 560 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Dnase2a-206ENSMUST00000145292 678 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 4732440D04Rik-202ENSMUST00000159618 413 ntTSL 1 (best) BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm44632-201ENSMUST00000207245 474 ntTSL 2 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 Gm21769-201ENSMUST00000211922 111 ntBASIC11.05□□□□□ -0.64
Vmn1r34G3XA52 AC091764.2-201ENSMUST00000218190 1590 ntTSL 5 BASIC11.05□□□□□ -0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.5 ms