Protein–RNA interactions for Protein: F8VQ70

Scaper, S phase cyclin A-associated protein in the ER, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,398 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ScaperF8VQ70 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Srebf2-201ENSMUST00000023100 4989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm13736-201ENSMUST00000119272 253 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm11667-201ENSMUST00000119828 486 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 S100a3-204ENSMUST00000200290 509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 AC107638.1-201ENSMUST00000213690 1061 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm45925-201ENSMUST00000218882 744 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cdc45-201ENSMUST00000000028 2143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 4930596D02Rik-201ENSMUST00000043266 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Mlf1-201ENSMUST00000061322 1113 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 1700001J03Rik-201ENSMUST00000073721 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Olfr605-201ENSMUST00000080660 1011 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Prrt3-201ENSMUST00000101059 3304 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cutal-201ENSMUST00000028228 2179 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Taf1c-201ENSMUST00000093099 3236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Scara5-201ENSMUST00000022610 3794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Hspa12b-201ENSMUST00000099349 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Fancc-218ENSMUST00000220684 2006 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tmem41b-201ENSMUST00000094097 3840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Adamts7-202ENSMUST00000113060 5098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Dusp26-203ENSMUST00000161713 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Dnmt1-207ENSMUST00000216540 5543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Taf2-201ENSMUST00000041733 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cd34-201ENSMUST00000016638 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Grin3a-201ENSMUST00000076674 7431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Lmntd1-201ENSMUST00000111706 2350 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Notch1-201ENSMUST00000028288 9488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Crhr2-208ENSMUST00000212633 2041 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Hsd17b10-202ENSMUST00000112617 992 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Bcas3os2-201ENSMUST00000134305 661 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm1667-201ENSMUST00000151651 558 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm17168-201ENSMUST00000169146 345 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm17028-201ENSMUST00000170026 704 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Stard10-207ENSMUST00000173270 670 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm37666-201ENSMUST00000194110 866 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Polr2i-201ENSMUST00000019882 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Dnajc4-201ENSMUST00000025915 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Hsd17b10-201ENSMUST00000026289 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Sst-201ENSMUST00000004480 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Ackr2-201ENSMUST00000050327 2853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Adra1b-201ENSMUST00000067258 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Rab3d-201ENSMUST00000115351 3835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Cacna1b-205ENSMUST00000114447 6987 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Arhgef2-229ENSMUST00000177303 3000 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Setdb2-201ENSMUST00000095775 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Aldh9a1-201ENSMUST00000028004 2835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Rtkn2-203ENSMUST00000117086 2246 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm26519-201ENSMUST00000181193 2249 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Pxn-202ENSMUST00000086523 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Snap23-202ENSMUST00000110711 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Map2k7-206ENSMUST00000110998 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
ScaperF8VQ70 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Kcnq2-208ENSMUST00000103051 4200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Luc7l2-207ENSMUST00000161227 2405 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm10961-201ENSMUST00000106703 144 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rps9-204ENSMUST00000108625 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm826-202ENSMUST00000109475 803 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm39460-201ENSMUST00000215728 1266 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 AC159819.2-201ENSMUST00000216151 342 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Defb22-201ENSMUST00000028966 628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Pf4-201ENSMUST00000031320 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rbp2-201ENSMUST00000035029 672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ntng1-201ENSMUST00000051253 327 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Nectin4-202ENSMUST00000094325 3245 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Sectm1b-201ENSMUST00000039309 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 4930513N10Rik-204ENSMUST00000212647 3957 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Col26a1-202ENSMUST00000111103 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Glis3-202ENSMUST00000112612 3016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Pcca-201ENSMUST00000038374 2592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm2673-201ENSMUST00000120958 1608 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Serpinb13-201ENSMUST00000027564 1607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Gm16070-203ENSMUST00000155588 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Kdm3a-214ENSMUST00000207023 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rabep2-202ENSMUST00000106407 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Klhl15-201ENSMUST00000096369 3944 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
ScaperF8VQ70 Nol4-206ENSMUST00000164186 2622 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.6 ms