Protein–RNA interactions for Protein: F8VPU6

Usp9y, Ubiquitin-specific peptidase 9, Y chromosome, mousemouse

Predictions only

Length 2,556 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp9yF8VPU6 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 AC137950.2-202ENSMUST00000227150 1635 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Eno3-206ENSMUST00000170716 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Sh3gl3-206ENSMUST00000179318 1489 ntTSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Lztr1-201ENSMUST00000023444 3112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Lrig2-205ENSMUST00000198332 3946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Zfp711-202ENSMUST00000113409 4330 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 2310035C23Rik-201ENSMUST00000039173 4328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tagln2-202ENSMUST00000111230 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm24891-201ENSMUST00000104391 136 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm14213-201ENSMUST00000119778 768 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm16296-201ENSMUST00000159905 325 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Wdr53-204ENSMUST00000178573 1153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm27530-201ENSMUST00000184096 98 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm28529-201ENSMUST00000186159 387 ntTSL 3 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm2965-201ENSMUST00000198365 343 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tex101-201ENSMUST00000078001 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm5989-201ENSMUST00000096092 2077 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Speg-205ENSMUST00000113590 3393 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dnm1-201ENSMUST00000078352 3246 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Slc37a4-202ENSMUST00000213268 1353 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Adtrp-202ENSMUST00000121404 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Sgce-209ENSMUST00000133306 1619 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm996-203ENSMUST00000188161 2925 ntAPPRIS P1 BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 1700065D16Rik-205ENSMUST00000190890 2903 ntBASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Atg16l1-203ENSMUST00000113190 3102 ntTSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Clcn3-203ENSMUST00000093490 5518 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.93□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Kyat1-204ENSMUST00000113661 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dclk2-206ENSMUST00000193632 2336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Atxn7l1-202ENSMUST00000090597 2563 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Prrt3-202ENSMUST00000204134 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Gm29040-201ENSMUST00000189899 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Nptn-206ENSMUST00000176557 1898 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Chchd3-202ENSMUST00000115091 1363 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Mcm8-202ENSMUST00000066559 3397 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Twnk-201ENSMUST00000026227 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Hspa8-202ENSMUST00000117557 2019 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Syn1-202ENSMUST00000115345 3261 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Slc7a3-201ENSMUST00000073927 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 2410131K14Rik-201ENSMUST00000049138 5649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Syn1-201ENSMUST00000081893 3209 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Vangl2-202ENSMUST00000111263 6528 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm12030-201ENSMUST00000121917 223 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm21972-201ENSMUST00000135197 776 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm12676-201ENSMUST00000149078 808 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
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Usp9yF8VPU6 Gm35625-201ENSMUST00000210416 316 ntTSL 3 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm7395-201ENSMUST00000216059 1045 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm9785-201ENSMUST00000062642 1006 ntBASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ankrd17-201ENSMUST00000014421 10458 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Nkain3-202ENSMUST00000119374 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm12503-201ENSMUST00000146576 3127 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ctsa-203ENSMUST00000103093 2534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Dubr-204ENSMUST00000186944 2052 ntTSL 2 BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Harbi1-202ENSMUST00000111322 1316 ntTSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Pyroxd2-201ENSMUST00000076505 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.92□□□□□ -0.82
Usp9yF8VPU6 Gm26513-201ENSMUST00000181802 2489 ntBASIC9.91□□□□□ -0.82
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