Protein–RNA interactions for Protein: E9Q6B2

Ccdc85c, Coiled-coil domain-containing protein 85C, mousemouse

Predictions only

Length 420 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc85cE9Q6B2 2900026A02Rik-201ENSMUST00000050125 5876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf138-202ENSMUST00000072847 3002 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Pafah1b1-202ENSMUST00000102520 5789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm9025-201ENSMUST00000122415 1575 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 AC113060.1-201ENSMUST00000225689 1573 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Grin1-204ENSMUST00000114310 4276 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Fam49a-201ENSMUST00000069005 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm8731-201ENSMUST00000118088 412 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Mrpl24-204ENSMUST00000121920 1115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm5700-201ENSMUST00000191483 989 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ighv6-7-201ENSMUST00000193397 357 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 4930413E15Rik-201ENSMUST00000202500 1290 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm29763-201ENSMUST00000205306 616 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ftl1-204ENSMUST00000210864 503 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 AC124752.1-201ENSMUST00000222131 776 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Taar9-201ENSMUST00000041180 1047 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 BC030499-201ENSMUST00000046361 959 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cdc25c-201ENSMUST00000060710 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 F2rl1-201ENSMUST00000022185 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cpsf4l-202ENSMUST00000100248 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Col18a1-201ENSMUST00000072755 5595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Acnat1-202ENSMUST00000107697 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm44056-201ENSMUST00000204623 1427 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Snhg18-201ENSMUST00000181536 1486 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Mbtd1-202ENSMUST00000063718 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Dgki-202ENSMUST00000090314 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Prr33-201ENSMUST00000054910 2251 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp68-201ENSMUST00000063262 2254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp786-201ENSMUST00000058844 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Disp1-205ENSMUST00000195372 4901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Tsku-204ENSMUST00000165901 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Snph-204ENSMUST00000109877 3367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Slc6a18-204ENSMUST00000220650 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Hspa14-201ENSMUST00000027961 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Fnbp1-202ENSMUST00000075326 1761 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Disc1-207ENSMUST00000121953 2676 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Poli-205ENSMUST00000161542 2736 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Zfp575-201ENSMUST00000094705 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Plekha5-212ENSMUST00000204876 1928 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Pax2-201ENSMUST00000004340 3095 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Acot6-201ENSMUST00000056822 3388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm43721-201ENSMUST00000199677 2313 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Tm9sf1-201ENSMUST00000002391 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ins2-204ENSMUST00000105932 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12579-201ENSMUST00000118040 783 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm12453-201ENSMUST00000121981 331 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm26368-201ENSMUST00000157826 118 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm25998-201ENSMUST00000175397 53 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Acy1-209ENSMUST00000215395 1051 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Acy1-211ENSMUST00000216400 1030 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ins2-201ENSMUST00000000220 478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 AC124433.1-201ENSMUST00000224483 1063 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cxcl1-201ENSMUST00000031327 953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Hils1-201ENSMUST00000038928 864 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Olfr1047-201ENSMUST00000099901 960 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Erp29-203ENSMUST00000130451 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 AC171277.1-201ENSMUST00000216902 1441 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Stk16-201ENSMUST00000027401 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cggbp1-201ENSMUST00000067744 4425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ddx4-202ENSMUST00000099166 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Eya4-206ENSMUST00000219315 3100 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Mtif3-202ENSMUST00000066675 4927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Stx5a-202ENSMUST00000073430 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Grm6-201ENSMUST00000000631 4291 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Bmp4-202ENSMUST00000100676 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Pcgf2-202ENSMUST00000103148 1438 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 E030018B13Rik-201ENSMUST00000177638 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 4930589O11Rik-201ENSMUST00000200768 920 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm45441-202ENSMUST00000209301 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Gm40761-201ENSMUST00000219123 1153 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Dgkb-205ENSMUST00000221176 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Armc7-201ENSMUST00000035240 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Rnf146-201ENSMUST00000037548 4402 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Rcsd1-201ENSMUST00000040357 2622 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Ccdc85cE9Q6B2 Mllt6-201ENSMUST00000044730 7274 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 122 ms