Protein–RNA interactions for Protein: E9PZQ1

Ddx60, DEAD (Asp-Glu-Ala-Asp) box polypeptide 60, mousemouse

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Length 1,711 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ddx60E9PZQ1 Cdk7-201ENSMUST00000091299 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tjap1-201ENSMUST00000012440 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Shank1-203ENSMUST00000107938 9826 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 1700003D09Rik-201ENSMUST00000141929 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Adamtsl4-202ENSMUST00000117782 4036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Susd3-201ENSMUST00000021816 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 2510009E07Rik-201ENSMUST00000053336 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Zyx-202ENSMUST00000164375 3188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Rprl1-201ENSMUST00000158050 327 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm8888-201ENSMUST00000177677 381 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 C530044C16Rik-202ENSMUST00000205217 1239 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Lgals4-207ENSMUST00000208971 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 AC153505.1-201ENSMUST00000218819 1071 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Colec11-203ENSMUST00000220836 887 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 AC154290.1-201ENSMUST00000223786 1240 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm5705-201ENSMUST00000066241 711 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Aamdc-202ENSMUST00000072725 776 ntTSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm26448-201ENSMUST00000082446 203 ntBASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Lysmd3-202ENSMUST00000224300 4250 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Naaa-201ENSMUST00000113102 2414 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tbkbp1-201ENSMUST00000066078 3338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Cmpk2-201ENSMUST00000020969 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ube2g1-201ENSMUST00000021148 3815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm5780-201ENSMUST00000217774 1834 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Hsph1-205ENSMUST00000201452 3140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Thap1-201ENSMUST00000036807 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm16312-201ENSMUST00000156285 362 ntTSL 3 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 1700029J03Rik-201ENSMUST00000185803 789 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Mrpl30-201ENSMUST00000027256 969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gsg1l-201ENSMUST00000073935 3923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Otx1-201ENSMUST00000006071 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Cyp2d34-201ENSMUST00000109515 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Hist2h4-201ENSMUST00000171473 1630 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Kif11-201ENSMUST00000012587 4819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tspyl3-201ENSMUST00000099194 3072 ntAPPRIS P1 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Orai2-201ENSMUST00000041048 3908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.22■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Mtrr-209ENSMUST00000223398 3861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 1300017J02Rik-202ENSMUST00000123530 1874 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Lin37-202ENSMUST00000108164 1312 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Pcnx2-204ENSMUST00000131127 3782 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Lats1-202ENSMUST00000165952 7209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Cdk2ap1-202ENSMUST00000111472 648 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tprkb-203ENSMUST00000113751 692 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ddx60E9PZQ1 Gimap3-202ENSMUST00000204036 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
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Ddx60E9PZQ1 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Prkar1b-203ENSMUST00000110890 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Prrx1-202ENSMUST00000075805 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 G3bp2-203ENSMUST00000167918 4232 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Cap2-201ENSMUST00000021802 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Pdgfc-201ENSMUST00000029652 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Tcf4-250ENSMUST00000202458 2610 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Ddx60E9PZQ1 Crmp1-201ENSMUST00000031004 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Zfp961-202ENSMUST00000131237 2689 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Mrpl55-202ENSMUST00000108784 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Mrps17-207ENSMUST00000121813 868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm6485-201ENSMUST00000160676 439 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Rpl41-203ENSMUST00000176683 437 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Gm45550-201ENSMUST00000209380 946 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Dync1li1-201ENSMUST00000047404 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Il21r-202ENSMUST00000206103 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Tspan1-201ENSMUST00000030465 1985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 Sh3bp5l-201ENSMUST00000073128 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Ddx60E9PZQ1 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.2 ms