Protein–RNA interactions for Protein: B1ATG9

Trabd2b, Metalloprotease TIKI2, mousemouse

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Length 517 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trabd2bB1ATG9 Dnajb4-204ENSMUST00000144950 2459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Sdc4-201ENSMUST00000017153 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Dnajc30-201ENSMUST00000071263 1661 ntAPPRIS P1 BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Tufm-201ENSMUST00000098048 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.78□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Pax6-203ENSMUST00000111082 3116 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Cd74-202ENSMUST00000097563 1410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Ppara-202ENSMUST00000109422 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Hnrnpr-201ENSMUST00000084219 2647 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Vcl-201ENSMUST00000022369 5267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Aacs-201ENSMUST00000031445 3239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Pou4f2-201ENSMUST00000034115 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Spon1-201ENSMUST00000046687 6161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Gm19221-201ENSMUST00000221827 1477 ntBASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Tnip1-204ENSMUST00000108885 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Rab39-201ENSMUST00000068449 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Nfatc2-202ENSMUST00000074618 6637 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Nr2c2-201ENSMUST00000113460 7647 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.52
Trabd2bB1ATG9 Pyroxd1-201ENSMUST00000041852 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Pir-201ENSMUST00000033749 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tmem17-201ENSMUST00000059319 1568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm11531-201ENSMUST00000117614 555 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 P2rx4-206ENSMUST00000142664 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm26361-201ENSMUST00000158868 186 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cabp2-201ENSMUST00000159148 1030 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rims3-204ENSMUST00000171363 977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Bet1l-207ENSMUST00000211527 298 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Gm33115-201ENSMUST00000220913 743 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cga-201ENSMUST00000029975 687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Qrfp-201ENSMUST00000057407 2927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Ppp1r15a-201ENSMUST00000042105 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Sgip1-201ENSMUST00000066824 4305 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Nek3-201ENSMUST00000033865 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Fam173b-203ENSMUST00000161061 2364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Lmln-201ENSMUST00000023497 6147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Kif1c-204ENSMUST00000137119 6596 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Sirpa-214ENSMUST00000179001 3812 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Usp19-204ENSMUST00000178075 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Usp19-202ENSMUST00000085044 4520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Draxin-201ENSMUST00000030862 5200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Trim26-210ENSMUST00000179968 3203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Got2-201ENSMUST00000034097 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Tekt2-201ENSMUST00000030658 1492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Nav1-207ENSMUST00000190298 8557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Tubgcp3-201ENSMUST00000000776 3797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Cela2a-201ENSMUST00000102481 1070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Gm12627-201ENSMUST00000178412 382 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Gm12614-201ENSMUST00000179586 382 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm12613-201ENSMUST00000180323 382 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm27046-201ENSMUST00000182160 463 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Pfn1-201ENSMUST00000018437 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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Trabd2bB1ATG9 Gm3508-201ENSMUST00000186012 792 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm43584-201ENSMUST00000199762 605 ntTSL 3 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm10109-202ENSMUST00000206890 1211 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Phgdh-ps1-201ENSMUST00000207540 754 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Gm5950-201ENSMUST00000213337 772 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Trabd2bB1ATG9 Kcnk7-201ENSMUST00000052448 1226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
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