Protein–RNA interactions for Protein: A7VMS3

H2-M5, Histocompatibility 2, M region locus 5, mousemouse

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Length 348 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-M5A7VMS3 Ska1-202ENSMUST00000177604 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rbm39-203ENSMUST00000109587 2810 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ankrd42-205ENSMUST00000138267 2827 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trim23-201ENSMUST00000022225 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Terf2ip-201ENSMUST00000052138 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm42957-201ENSMUST00000137564 3624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Larp4-202ENSMUST00000100206 6523 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Snord83b-201ENSMUST00000104546 94 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Epb41-207ENSMUST00000105975 5235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tmem53-203ENSMUST00000106434 923 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Rps3-202ENSMUST00000107096 952 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Nelfcd-202ENSMUST00000109075 2279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm15370-201ENSMUST00000117158 253 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Capn11-201ENSMUST00000120717 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm11964-201ENSMUST00000120982 444 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm14381-201ENSMUST00000122105 414 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tmem80-204ENSMUST00000128906 1387 ntTSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 1700128E19Rik-201ENSMUST00000134409 2439 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Acin1-219ENSMUST00000148754 2373 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Poc1b-203ENSMUST00000159228 1799 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tead1-207ENSMUST00000165036 1248 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Efemp2-209ENSMUST00000167371 1382 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Tead1-212ENSMUST00000171197 1074 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm20605-201ENSMUST00000177545 4464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Fkbp2-202ENSMUST00000177752 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Syt2-204ENSMUST00000188842 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Olfr1414-202ENSMUST00000189174 1159 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Ovol3-201ENSMUST00000189482 731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm28411-201ENSMUST00000189864 341 ntTSL 3 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm38158-201ENSMUST00000194617 339 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm38341-201ENSMUST00000195357 515 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Taldo1-204ENSMUST00000211654 1362 ntTSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 AC132384.14-201ENSMUST00000219346 1147 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm9257-201ENSMUST00000221254 232 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm8227-201ENSMUST00000223306 571 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Crybg3-201ENSMUST00000044604 5231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Thtpa-201ENSMUST00000050575 2830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Zfp125-201ENSMUST00000079237 2488 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC10.71□□□□□ -0.69
H2-M5A7VMS3 Trio-201ENSMUST00000090247 11495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Psmd1-201ENSMUST00000027432 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 D230017M19Rik-201ENSMUST00000180722 3096 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC10.71□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tmem104-201ENSMUST00000061450 4564 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm36356-201ENSMUST00000209224 2277 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Eya1-209ENSMUST00000190337 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tbc1d2-201ENSMUST00000084621 4315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Grin1-201ENSMUST00000028335 4238 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sema6d-206ENSMUST00000103239 6225 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Arhgap27-204ENSMUST00000107024 3976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm15459-201ENSMUST00000117405 1941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm8355-201ENSMUST00000177767 1941 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 4930488N24Rik-201ENSMUST00000188802 1527 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Tekt4-201ENSMUST00000025002 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ascc1-202ENSMUST00000164083 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm30725-201ENSMUST00000195170 1419 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Lrrfip2-214ENSMUST00000217117 1363 ntTSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sphk2-203ENSMUST00000210060 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Pin4-201ENSMUST00000113627 489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm13350-201ENSMUST00000120519 479 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mogat1-201ENSMUST00000012331 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm42420-201ENSMUST00000126621 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 4933407E24Rik-201ENSMUST00000133499 969 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm12199-201ENSMUST00000137567 517 ntTSL 3 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm2991-201ENSMUST00000173338 480 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm2164-201ENSMUST00000184062 424 ntTSL 2 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Mir8109-201ENSMUST00000184375 117 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm4598-201ENSMUST00000206756 1080 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Morn2-202ENSMUST00000227729 656 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ddit3-201ENSMUST00000026475 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Cym-201ENSMUST00000029504 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Ctrc-201ENSMUST00000037059 951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 9430041J12Rik-201ENSMUST00000050989 534 ntBASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Epb41l5-201ENSMUST00000027632 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Pak6-201ENSMUST00000099557 4411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 5930412G12Rik-203ENSMUST00000134673 2087 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sgsm3-208ENSMUST00000139517 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Astn1-202ENSMUST00000170718 2927 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Gm10561-201ENSMUST00000181563 1943 ntTSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Pcid2-201ENSMUST00000164416 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sept8-204ENSMUST00000121334 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Igsf23-204ENSMUST00000208974 1850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Sun2-202ENSMUST00000089311 3709 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Pdlim5-206ENSMUST00000195975 1845 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Olfr56-204ENSMUST00000203149 1808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Vps4b-202ENSMUST00000112736 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
H2-M5A7VMS3 Shisa9-201ENSMUST00000023138 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.7□□□□□ -0.7
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