Protein–RNA interactions for Protein: A2AQ19

Rtf1, RNA polymerase-associated protein RTF1 homolog, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 715 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rtf1A2AQ19 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 9430021M05Rik-201ENSMUST00000145985 1201 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cmtm1-201ENSMUST00000159039 1130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm5070-201ENSMUST00000177599 862 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rpl36-ps4-201ENSMUST00000179601 354 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm2260-201ENSMUST00000184965 657 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm37312-201ENSMUST00000195753 685 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm42937-201ENSMUST00000197360 752 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rassf4-202ENSMUST00000203029 1243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm45691-201ENSMUST00000206905 1120 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm31224-201ENSMUST00000212682 513 ntTSL 3 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tpd52l1-203ENSMUST00000213639 827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm19605-202ENSMUST00000221514 1084 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Nit2-201ENSMUST00000023432 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Asphd1-201ENSMUST00000052937 730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Casc4-202ENSMUST00000089912 3602 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 AC122197.2-201ENSMUST00000219196 1635 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Pcbp3-203ENSMUST00000105411 2544 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ahdc1-201ENSMUST00000044521 6105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Crry-ps-201ENSMUST00000079090 1309 ntBASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Nfic-202ENSMUST00000078185 3163 ntTSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm20149-201ENSMUST00000214691 1667 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 H2-Q1-201ENSMUST00000073208 2024 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Kdm4a-202ENSMUST00000097911 4550 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Fcrls-201ENSMUST00000090986 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Adck1-202ENSMUST00000166940 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Lctl-201ENSMUST00000034969 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 AC113441.2-201ENSMUST00000221538 1468 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Dnaaf2-201ENSMUST00000021356 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm45495-201ENSMUST00000200940 1700 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Sh3bp2-207ENSMUST00000179943 2935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Klhl26-203ENSMUST00000209415 2919 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Sfswap-201ENSMUST00000053737 3313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm13442-201ENSMUST00000135749 663 ntTSL 3 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm6963-201ENSMUST00000147879 379 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rhoc-204ENSMUST00000176347 583 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Rprl1-202ENSMUST00000198476 238 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm32468-201ENSMUST00000214199 1040 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 AC124171.1-201ENSMUST00000221151 567 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Brd2-202ENSMUST00000095347 2617 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Mfsd13b-205ENSMUST00000216241 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Pcdhgb1-201ENSMUST00000192931 4723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Hk2-204ENSMUST00000170833 2792 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ppp3cb-205ENSMUST00000161445 3298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tmem169-201ENSMUST00000027380 2928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Zc3h6-202ENSMUST00000110320 4916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Tecpr1-201ENSMUST00000085701 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Esr1-204ENSMUST00000105590 6339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Spop-202ENSMUST00000107724 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Madd-212ENSMUST00000111375 5706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Dtnb-223ENSMUST00000174547 2112 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Syncrip-210ENSMUST00000174391 6257 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Dhx30-201ENSMUST00000062368 3806 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Prnd-203ENSMUST00000110171 1938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Git1-201ENSMUST00000037285 3512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Fthl17d-201ENSMUST00000105004 856 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm12015-201ENSMUST00000117065 843 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Aif1-203ENSMUST00000172693 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Adtrp-204ENSMUST00000179758 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm44262-201ENSMUST00000204969 372 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm33104-201ENSMUST00000214178 1010 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Pglyrp1-201ENSMUST00000032573 694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 1700028J19Rik-201ENSMUST00000037220 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Klk1b27-201ENSMUST00000079859 889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Spaca4-201ENSMUST00000094424 707 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Slc5a11-201ENSMUST00000033035 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Krt31-201ENSMUST00000007318 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Gm15477-201ENSMUST00000140578 2130 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Fancc-202ENSMUST00000099444 2288 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Irs4-201ENSMUST00000067841 6294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Trp63-204ENSMUST00000115305 1729 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ankrd61-201ENSMUST00000079624 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Dpp6-201ENSMUST00000071500 3826 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Myh7-204ENSMUST00000168485 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Mtmr2-201ENSMUST00000034396 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Cpped1-201ENSMUST00000073371 1922 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Slc25a25-203ENSMUST00000113307 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Rtf1A2AQ19 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms