Protein–RNA interactions for Protein: A2ANA3

Cldn34c4, Claudin 34C4, mousemouse

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34c4A2ANA3 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 AC159474.1-201ENSMUST00000218454 374 ntTSL 3 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gstt2-203ENSMUST00000218500 794 ntTSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 AC093022.5-201ENSMUST00000226841 1079 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm9396-201ENSMUST00000076703 567 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm10012-201ENSMUST00000078252 192 ntBASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Tsga10-202ENSMUST00000088072 3837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Lig1-210ENSMUST00000165964 3166 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Dach2-201ENSMUST00000067219 2520 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Pef1-201ENSMUST00000030563 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Ptbp1-216ENSMUST00000172282 3110 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Xlr-202ENSMUST00000067782 1860 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Tmem132a-201ENSMUST00000025645 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Rxfp3-201ENSMUST00000058007 4275 ntAPPRIS P1 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Mrm3-201ENSMUST00000040577 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Adora1-201ENSMUST00000038191 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Atp13a1-201ENSMUST00000034326 3915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Usp18-201ENSMUST00000032198 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Pcdhgc4-201ENSMUST00000066140 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Stab1-201ENSMUST00000036618 7999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Sirt3-201ENSMUST00000026559 1461 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Utp23-203ENSMUST00000137116 2921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Sema4f-201ENSMUST00000000641 4086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Rnf180-201ENSMUST00000069686 1728 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Ccng2-202ENSMUST00000121127 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.16□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Arhgef28-201ENSMUST00000109426 5387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Herpud1-205ENSMUST00000161576 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Tor1aip1-202ENSMUST00000097527 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 4933412E12Rik-201ENSMUST00000217853 1698 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Samd11-204ENSMUST00000218788 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Polr1b-201ENSMUST00000028874 2769 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Vps52-201ENSMUST00000025178 3332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm28036-202ENSMUST00000132494 5505 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Bcl2l15-202ENSMUST00000106822 1902 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Pla2g6-206ENSMUST00000173163 3018 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Scube2-201ENSMUST00000007423 3571 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Agxt2-204ENSMUST00000110542 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Cnbp-209ENSMUST00000204890 1614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Grm4-202ENSMUST00000118489 2976 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Zfand4-202ENSMUST00000112900 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm11725-201ENSMUST00000125607 1850 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm36970-201ENSMUST00000193688 1859 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Il2rb-201ENSMUST00000089398 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm595-201ENSMUST00000114928 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Catsper3-202ENSMUST00000109898 1311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm26880-201ENSMUST00000181610 1318 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Med4-201ENSMUST00000022705 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm16741-201ENSMUST00000145085 1818 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 4930432B10Rik-201ENSMUST00000181688 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Pabpc2-201ENSMUST00000063219 2586 ntAPPRIS P1 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Rhox2b-201ENSMUST00000115191 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm8213-201ENSMUST00000118191 441 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm11803-201ENSMUST00000119966 444 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm10863-204ENSMUST00000147620 776 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm24644-201ENSMUST00000157114 139 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Dpy30-202ENSMUST00000164832 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 1600014C23Rik-201ENSMUST00000178179 518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm24196-201ENSMUST00000179161 110 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 C430014B12Rik-201ENSMUST00000181720 1001 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm38293-201ENSMUST00000193209 600 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Gm44780-201ENSMUST00000205409 581 ntTSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Kitl-204ENSMUST00000218200 564 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Bphl-201ENSMUST00000040656 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Bst2-201ENSMUST00000051672 792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Plk-ps1-201ENSMUST00000119494 1787 ntBASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Prr18-202ENSMUST00000163887 3251 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Dcc-202ENSMUST00000114943 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Smg8-201ENSMUST00000020801 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Hnrnpk-202ENSMUST00000116403 2970 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Ccdc114-201ENSMUST00000038720 2460 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 R3hdm2-210ENSMUST00000164831 2937 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.78
Cldn34c4A2ANA3 Bicra-204ENSMUST00000210781 5975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Erich5-201ENSMUST00000060894 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Osbp2-203ENSMUST00000102950 3077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Hdac5-202ENSMUST00000107150 3759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Zfp64-203ENSMUST00000109162 2848 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Trim9-209ENSMUST00000222316 3049 ntTSL 2 BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Slc39a3-205ENSMUST00000168076 3461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Vsir-203ENSMUST00000105460 4843 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Vsir-201ENSMUST00000020301 4846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Gm26588-202ENSMUST00000181355 2538 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Rnf26-205ENSMUST00000215685 1804 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Uckl1-201ENSMUST00000057816 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Gm17705-201ENSMUST00000172285 1555 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Cog7-203ENSMUST00000205438 3355 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Cldn34c4A2ANA3 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.2 ms