Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z320

Krt27, Keratin, type I cytoskeletal 27, mousemouse

Predictions only

Length 448 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt27Q9Z320 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Wnt7b-202ENSMUST00000109424 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm13492-201ENSMUST00000119772 665 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm11591-201ENSMUST00000120063 702 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Pomgnt1-205ENSMUST00000121052 2693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm16191-202ENSMUST00000148464 484 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm16379-201ENSMUST00000161469 348 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Six4-202ENSMUST00000175693 6817 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm5106-201ENSMUST00000181058 1334 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 1700120C14Rik-202ENSMUST00000187967 391 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm8762-201ENSMUST00000193486 339 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ncln-201ENSMUST00000020463 3118 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 B230209E15Rik-201ENSMUST00000209115 1597 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm45338-203ENSMUST00000210371 1009 ntTSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Treml1-201ENSMUST00000024792 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Fau-201ENSMUST00000043074 574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Atp6v1h-201ENSMUST00000044369 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 n-R5s195-201ENSMUST00000082891 119 ntBASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Fzd4-201ENSMUST00000058755 6720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Kif1a-202ENSMUST00000112958 5931 ntTSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Map3k4-201ENSMUST00000089058 5305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Slc4a2-202ENSMUST00000115047 4264 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Plekhd1-201ENSMUST00000140770 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Pitpnm3-202ENSMUST00000108508 6450 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Pcdhac1-201ENSMUST00000007584 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Egfem1-202ENSMUST00000119598 2687 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.26□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm26823-201ENSMUST00000181425 2361 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 9530077C05Rik-201ENSMUST00000058868 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm8228-201ENSMUST00000189949 2192 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Osgepl1-201ENSMUST00000027265 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Il2rg-201ENSMUST00000033664 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Rccd1-201ENSMUST00000047362 3336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ints5-201ENSMUST00000096249 3294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Csf1-202ENSMUST00000118593 3058 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Tifa-203ENSMUST00000164447 1538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Pdxdc1-204ENSMUST00000115804 2880 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Hspa4l-208ENSMUST00000204702 9479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Myo18a-220ENSMUST00000164334 5381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Pcdh1-202ENSMUST00000159405 3880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Trav4-2-201ENSMUST00000103637 370 ntAPPRIS P1 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Tpd52l2-203ENSMUST00000108799 985 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Wfdc9-202ENSMUST00000109335 547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm12502-201ENSMUST00000120197 444 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Adamtsl1-204ENSMUST00000120678 977 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Pcp2-206ENSMUST00000144977 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm12167-201ENSMUST00000148132 578 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 BC023719-201ENSMUST00000174728 978 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 AC160029.2-201ENSMUST00000218285 548 ntTSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 AC148335.1-201ENSMUST00000218778 818 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Tmem54-202ENSMUST00000030577 988 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Zfp64-201ENSMUST00000087971 2438 ntTSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ttbk2-203ENSMUST00000085840 11152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Myo15b-208ENSMUST00000222123 5154 ntTSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Fam214b-201ENSMUST00000036462 3074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Brwd1-202ENSMUST00000099502 8547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ltbp2-202ENSMUST00000110254 6602 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Tmem237-202ENSMUST00000094917 1869 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Med25-211ENSMUST00000208551 2678 ntTSL 2 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Pole2-201ENSMUST00000021359 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Cdkl2-203ENSMUST00000113140 2559 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ap3m2-201ENSMUST00000163739 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.25□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Tuba1a-201ENSMUST00000097014 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 4930550L24Rik-201ENSMUST00000062542 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Dlc1-201ENSMUST00000033923 6159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Neurog3-201ENSMUST00000050103 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Ahi1-201ENSMUST00000105525 4851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Yae1d1-204ENSMUST00000222796 1382 ntTSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Fam118b-203ENSMUST00000121564 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Timd2-201ENSMUST00000055102 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 E130114P18Rik-202ENSMUST00000107068 1132 ntAPPRIS P5 TSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm25261-201ENSMUST00000157416 134 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Snora78-201ENSMUST00000158630 128 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm6222-202ENSMUST00000182143 629 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Mb-201ENSMUST00000019037 966 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm42067-201ENSMUST00000209642 647 ntTSL 2 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm36198-201ENSMUST00000217490 416 ntTSL 3 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm10371-202ENSMUST00000228010 1081 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 AC140451.2-201ENSMUST00000228030 664 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC13.24□□□□□ -0.29
Krt27Q9Z320 Gm25857-201ENSMUST00000082788 129 ntBASIC13.24□□□□□ -0.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.8 ms