Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1X0

Ccl27, C-C motif chemokine 27, mousemouse

Predictions only

Length 120 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccl27Q9Z1X0 4933427G23Rik-201ENSMUST00000122963 2515 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 5430419D17Rik-201ENSMUST00000050586 2928 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 6030442K20Rik-201ENSMUST00000180835 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 CT010488.1-201ENSMUST00000214890 1522 ntTSL 1 (best) BASIC11.64□□□□□ -0.55
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Ccl27Q9Z1X0 Mettl8-202ENSMUST00000100037 2254 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccl27Q9Z1X0 Nr2c2-202ENSMUST00000113463 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Ttc4-201ENSMUST00000026480 2121 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.63□□□□□ -0.55
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Ccl27Q9Z1X0 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Mid1-215ENSMUST00000171433 2546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccl27Q9Z1X0 Bmp7-201ENSMUST00000009143 3670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccl27Q9Z1X0 Cox19-201ENSMUST00000049630 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccl27Q9Z1X0 Osbpl1a-201ENSMUST00000074352 3956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Insrr-202ENSMUST00000107582 4694 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm26819-201ENSMUST00000180656 5128 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Park7-202ENSMUST00000105673 919 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 1700049J03Rik-201ENSMUST00000011196 421 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Hmgcll1-202ENSMUST00000117981 1189 ntTSL 5 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm16302-201ENSMUST00000159268 428 ntTSL 3 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Pcgf1-202ENSMUST00000165164 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Anapc16-205ENSMUST00000182912 566 ntTSL 2 BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccl27Q9Z1X0 Gm8176-201ENSMUST00000191297 1099 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm44974-201ENSMUST00000206387 1279 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Olfr284-202ENSMUST00000206647 966 ntBASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm20083-202ENSMUST00000206663 1008 ntTSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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Ccl27Q9Z1X0 Rrp36-201ENSMUST00000024766 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 Sesn2-201ENSMUST00000030724 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
Ccl27Q9Z1X0 BC055324-202ENSMUST00000097493 3217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.62□□□□□ -0.55
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