Protein–RNA interactions for Protein: Q9Z1P4

Lgr5, Leucine-rich repeat-containing G-protein coupled receptor 5, mousemouse

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Length 907 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lgr5Q9Z1P4 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Akap17b-201ENSMUST00000051906 6003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Pepd-201ENSMUST00000075068 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 6230400D17Rik-201ENSMUST00000180987 1554 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ipo13-201ENSMUST00000036156 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Skap1-206ENSMUST00000107663 742 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Fam129a-203ENSMUST00000111875 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm53-203ENSMUST00000143887 757 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm17231-202ENSMUST00000165858 663 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm17099-201ENSMUST00000166780 412 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm27438-201ENSMUST00000183480 110 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cyb561-206ENSMUST00000184086 1130 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gng8-204ENSMUST00000205716 432 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Calca-205ENSMUST00000205933 458 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm44545-201ENSMUST00000208262 746 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 AC162938.2-204ENSMUST00000216455 984 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm4797-201ENSMUST00000219075 1283 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 AC134328.1-201ENSMUST00000222693 667 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Yes1-201ENSMUST00000072311 4586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Clca2-203ENSMUST00000198993 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Chtop-205ENSMUST00000107343 3118 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Arhgef12-202ENSMUST00000165665 10752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ano6-201ENSMUST00000071874 4927 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Etv1-211ENSMUST00000162563 1865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tcn2-201ENSMUST00000020710 1897 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Platr7-201ENSMUST00000181466 1334 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tmem26-201ENSMUST00000080995 5048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Camk2d-202ENSMUST00000066466 4075 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cdc42ep2-201ENSMUST00000055458 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm3830-201ENSMUST00000185540 1715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Taf6-203ENSMUST00000110937 2093 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Dusp6-201ENSMUST00000020118 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Ttc7-201ENSMUST00000041110 4614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cspp1-204ENSMUST00000119714 1268 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Gm17391-201ENSMUST00000171036 126 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 AC153830.1-201ENSMUST00000218522 594 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Zfp954-201ENSMUST00000056246 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Tesmin-203ENSMUST00000142193 2279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mpzl2-201ENSMUST00000034600 3107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
Lgr5Q9Z1P4 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
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Lgr5Q9Z1P4 Thnsl2-202ENSMUST00000160918 2077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Ampd2-202ENSMUST00000102637 3586 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Pcdha5-201ENSMUST00000192168 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 B430212C06Rik-205ENSMUST00000145081 2623 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm45706-201ENSMUST00000213063 2136 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Agt-201ENSMUST00000063278 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Sema6c-202ENSMUST00000090823 4029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Fam227a-204ENSMUST00000187519 2283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Grip2-205ENSMUST00000162300 5206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm26286-201ENSMUST00000104166 134 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
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Lgr5Q9Z1P4 Zfp229-206ENSMUST00000183192 653 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 1700030I03Rik-201ENSMUST00000192978 942 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm45021-201ENSMUST00000204521 369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Olfr707-202ENSMUST00000208759 1242 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm44710-201ENSMUST00000208885 471 ntTSL 2 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 AC156504.2-201ENSMUST00000213800 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ccdc153-202ENSMUST00000213891 792 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Prss52-201ENSMUST00000022537 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 AC135469.1-201ENSMUST00000225984 772 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Gm7551-201ENSMUST00000089593 1074 ntBASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Dcaf6-201ENSMUST00000027856 4110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
Lgr5Q9Z1P4 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.89□□□□□ -0.03
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