Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLM8

Dclk1, Serine/threonine-protein kinase DCLK1, mousemouse

Predictions only

Length 756 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dclk1Q9JLM8 4930453N24Rik-201ENSMUST00000076991 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Fbxl4-201ENSMUST00000039234 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Ncln-202ENSMUST00000118498 2841 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Edc4-201ENSMUST00000040254 4780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Zyg11b-201ENSMUST00000043616 8691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Cbln4-201ENSMUST00000087950 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Kdm2b-204ENSMUST00000118027 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Mme-206ENSMUST00000194150 3345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Acrbp-204ENSMUST00000112413 672 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm6161-201ENSMUST00000121942 1102 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm15569-201ENSMUST00000133675 594 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm6153-201ENSMUST00000172004 1058 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm20420-201ENSMUST00000173178 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm37800-202ENSMUST00000193667 553 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm37707-201ENSMUST00000195309 325 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm5641-202ENSMUST00000198699 1080 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Chn2-212ENSMUST00000204115 783 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Isoc2b-205ENSMUST00000208816 820 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 AC170997.1-201ENSMUST00000214554 1053 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 AC134860.1-201ENSMUST00000224867 660 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 AC151275.1-201ENSMUST00000224870 585 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Ifi27-201ENSMUST00000066701 889 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Uba52-201ENSMUST00000081940 541 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Uqcc3-201ENSMUST00000096253 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Abi3-201ENSMUST00000059026 4006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Zfp61-208ENSMUST00000165241 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Morn1-201ENSMUST00000030915 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Tbx3-201ENSMUST00000018748 4856 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Pomgnt1-201ENSMUST00000106494 2226 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Tpm1-202ENSMUST00000034928 1824 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Ndufaf1-203ENSMUST00000110802 1308 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Pard3b-202ENSMUST00000075374 8392 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Fbxo28-201ENSMUST00000051431 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Thumpd1-201ENSMUST00000033236 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Nbeal2-206ENSMUST00000133191 8782 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Camk2d-203ENSMUST00000106399 4169 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Atp5s-204ENSMUST00000220916 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Krit1-211ENSMUST00000200386 2343 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm10544-201ENSMUST00000180516 2239 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm14193-201ENSMUST00000105067 153 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm15566-201ENSMUST00000121130 590 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm12069-201ENSMUST00000145127 806 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm15524-201ENSMUST00000159874 463 ntTSL 3 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm4462-201ENSMUST00000166453 492 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 6530401F13Rik-201ENSMUST00000166971 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Hspb9-202ENSMUST00000169833 726 ntAPPRIS P2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 9930004E17Rik-201ENSMUST00000180031 498 ntBASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm45572-201ENSMUST00000211774 750 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm20735-202ENSMUST00000212387 519 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 1700011B04Rik-203ENSMUST00000220654 1033 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 1700011B04Rik-209ENSMUST00000221760 779 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 AC124687.5-201ENSMUST00000222734 596 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Pcgf5-204ENSMUST00000224772 1266 ntAPPRIS ALT1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Nphp4-202ENSMUST00000081393 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Zfp28-201ENSMUST00000081022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm37240-203ENSMUST00000154148 2913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Ubtf-209ENSMUST00000173870 2936 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Prrxl1-201ENSMUST00000068938 1610 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Pde8a-201ENSMUST00000026672 3802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm12474-201ENSMUST00000122898 1410 ntTSL 2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Unc5d-204ENSMUST00000210785 3404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Kctd14-201ENSMUST00000050732 2343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Themis3-201ENSMUST00000024914 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Pex2-202ENSMUST00000071280 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Avpr1a-201ENSMUST00000020323 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Ell3-202ENSMUST00000116432 1674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Eif4g3-215ENSMUST00000203828 5289 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Anxa4-202ENSMUST00000113675 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Il17re-202ENSMUST00000058548 2940 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Ormdl1-201ENSMUST00000027266 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 H2-T10-201ENSMUST00000166442 1481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Vav1-203ENSMUST00000112870 2743 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Muc20-201ENSMUST00000041123 2299 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Ip6k2-201ENSMUST00000085018 1846 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Zbed4-201ENSMUST00000041297 5425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Blzf1-203ENSMUST00000120447 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Tprkb-204ENSMUST00000113752 749 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm2044-201ENSMUST00000130771 911 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm14236-201ENSMUST00000142374 872 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Pitpnm2os2-201ENSMUST00000159053 828 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm16167-201ENSMUST00000160428 1065 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm8494-201ENSMUST00000178171 1233 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Gm13272-201ENSMUST00000179425 811 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Dclk1Q9JLM8 Vmn1r206-201ENSMUST00000187140 1135 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
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