Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Jam3-201ENSMUST00000034472 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Slc35a4-206ENSMUST00000186538 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Sh3gl2-201ENSMUST00000030212 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Ccnk-202ENSMUST00000221167 2789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm29455-201ENSMUST00000186504 2659 ntTSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Rbm39-217ENSMUST00000146297 2580 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 D930048N14Rik-202ENSMUST00000117859 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Col8a1-201ENSMUST00000089332 5108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.21□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Aicda-201ENSMUST00000043301 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Cbfa2t2-202ENSMUST00000099178 3247 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 2810429I04Rik-203ENSMUST00000181708 4769 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Herc4-201ENSMUST00000020258 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Tom1-202ENSMUST00000165630 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Acrbp-205ENSMUST00000112414 1498 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Camta2-202ENSMUST00000100933 4383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Camta2-204ENSMUST00000108545 4377 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Camta2-206ENSMUST00000120261 4398 ntTSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Nt5c3b-205ENSMUST00000107399 1427 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Usp20-211ENSMUST00000170476 4970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Sbno2-209ENSMUST00000219260 4850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Spcs3-201ENSMUST00000067476 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Cep89-201ENSMUST00000079414 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Dnajc5-202ENSMUST00000108796 934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm13365-201ENSMUST00000121188 973 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm12264-201ENSMUST00000123949 500 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm12786-201ENSMUST00000129617 644 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 3000002C10Rik-202ENSMUST00000133495 1008 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Iqcf1-202ENSMUST00000164965 523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm18889-201ENSMUST00000174284 929 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Prss54-202ENSMUST00000180075 1152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm36972-201ENSMUST00000194000 676 ntTSL 3 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gzmm-201ENSMUST00000020549 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Cmc2-201ENSMUST00000078589 523 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Pou6f1-201ENSMUST00000058274 2523 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Tspan18-202ENSMUST00000111265 3751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Anxa6-201ENSMUST00000102727 2471 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Anxa6-202ENSMUST00000108883 2489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Ilf3-202ENSMUST00000115414 3606 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Nek4-207ENSMUST00000228328 4245 ntAPPRIS P2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Mmel1-207ENSMUST00000163732 2935 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Zfp109-202ENSMUST00000206362 2932 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Taz-204ENSMUST00000124200 1742 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Tiam1-203ENSMUST00000114122 4596 ntTSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Muc1-201ENSMUST00000041142 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Ppp4r1-201ENSMUST00000073104 3850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Map3k12-208ENSMUST00000171565 4318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Kcnt1-211ENSMUST00000171268 3771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Iqsec3-203ENSMUST00000151397 8067 ntTSL 2 BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Rims2-204ENSMUST00000226410 3685 ntBASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Zfp957-201ENSMUST00000040802 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Ddx10-201ENSMUST00000065630 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.2□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Suclg1-201ENSMUST00000064740 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Cyp26b1-204ENSMUST00000204146 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Crot-201ENSMUST00000003720 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Enpp5-203ENSMUST00000154166 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Zfp641-201ENSMUST00000023722 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Hk3-201ENSMUST00000052949 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 F10-204ENSMUST00000128418 1395 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Ilkap-201ENSMUST00000027534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Tmprss2-201ENSMUST00000000395 3159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Lingo1-206ENSMUST00000210032 3627 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Rpn1-201ENSMUST00000032143 3633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Mpi-201ENSMUST00000034856 1780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Sorbs3-203ENSMUST00000227653 3061 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Zscan10-205ENSMUST00000120967 2609 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Higd1b-202ENSMUST00000107072 497 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Higd1b-203ENSMUST00000107073 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm14494-201ENSMUST00000118786 435 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Orai3-202ENSMUST00000118865 768 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 9130230N09Rik-201ENSMUST00000174568 663 ntTSL 3 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 1190007I07Rik-202ENSMUST00000176200 586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Arfgap1-213ENSMUST00000184394 1209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Cdipt-205ENSMUST00000206450 951 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm16476-201ENSMUST00000221544 139 ntBASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Yif1b-201ENSMUST00000032809 1111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 1700018B24Rik-201ENSMUST00000036023 593 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm9789-201ENSMUST00000062524 397 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Atp5h-202ENSMUST00000073791 659 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Fam109b-203ENSMUST00000161178 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Slc45a3-201ENSMUST00000027695 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Bpifb9b-201ENSMUST00000088921 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Ttc23-201ENSMUST00000032774 2492 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Kat7-203ENSMUST00000103159 3248 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Zfyve26-203ENSMUST00000218377 2726 ntTSL 5 BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Banp-204ENSMUST00000170857 5444 ntTSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Trem1Q9JKE2 Gpat3-202ENSMUST00000092990 3035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.19□□□□□ -0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 100.4 ms