Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESK9

Rb1cc1, RB1-inducible coiled-coil protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,588 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rb1cc1Q9ESK9 Prc1-211ENSMUST00000174199 2128 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Alppl2-202ENSMUST00000188310 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Bpi-203ENSMUST00000109500 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm12198-201ENSMUST00000154068 1809 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Chrna9-201ENSMUST00000031108 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Sfxn3-202ENSMUST00000084493 2843 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm14963-201ENSMUST00000146751 2558 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Mfsd11-212ENSMUST00000153084 1194 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Acat3-202ENSMUST00000160378 987 ntTSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm45594-201ENSMUST00000211717 241 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm2553-201ENSMUST00000215986 605 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Bag6-202ENSMUST00000166426 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Plcb3-201ENSMUST00000025912 4201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cyth3-201ENSMUST00000110727 2068 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc187-201ENSMUST00000057224 3148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb1-201ENSMUST00000005620 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Prdm5-202ENSMUST00000031976 2155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Bckdhb-205ENSMUST00000190166 1398 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Sun3-202ENSMUST00000102909 1205 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cdc42se1-203ENSMUST00000107200 637 ntTSL 3 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Smyd1-205ENSMUST00000173297 947 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 1700008C04Rik-201ENSMUST00000218606 797 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc28b-201ENSMUST00000030586 879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Zkscan3-208ENSMUST00000224820 5398 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Mir17hg-201ENSMUST00000134140 3536 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Hnrnpdl-202ENSMUST00000128187 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Flrt2-202ENSMUST00000110117 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Kars-202ENSMUST00000093120 2131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 4933406C10Rik-201ENSMUST00000180391 1451 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 AC166836.1-201ENSMUST00000219933 1795 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Cfap161-201ENSMUST00000011298 1335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Tmem56-204ENSMUST00000135818 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm44315-201ENSMUST00000203041 219 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Fabp6-201ENSMUST00000020672 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 1700012D14Rik-204ENSMUST00000210788 547 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Gm29208-205ENSMUST00000214517 1056 ntTSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
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Rb1cc1Q9ESK9 Gm5544-201ENSMUST00000098828 891 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 P2rx1-201ENSMUST00000021141 2486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Prpf40a-206ENSMUST00000209364 2833 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Foxo4-201ENSMUST00000062000 3162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Elovl6-202ENSMUST00000197070 2275 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Kif5b-201ENSMUST00000025083 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Rb1cc1Q9ESK9 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gpd1l-202ENSMUST00000129305 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Enpp7-202ENSMUST00000106273 1408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Leprot-202ENSMUST00000106927 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Prkaca-202ENSMUST00000211558 1399 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Tcirg1-211ENSMUST00000145791 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Krtap4-9-201ENSMUST00000105059 1059 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm11354-201ENSMUST00000121974 422 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Sumo3-203ENSMUST00000124024 776 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Parvaos-201ENSMUST00000154848 1285 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 AC160028.1-201ENSMUST00000219645 1095 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Nmur1-201ENSMUST00000027440 1218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
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Rb1cc1Q9ESK9 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Olfm4-201ENSMUST00000088735 1640 ntTSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Cpxm2-201ENSMUST00000033149 3498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Ccdc126-202ENSMUST00000114491 2372 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm7150-201ENSMUST00000122032 981 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm9192-201ENSMUST00000183221 985 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rbp2-202ENSMUST00000187905 611 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm37981-201ENSMUST00000194280 535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm36074-201ENSMUST00000221383 591 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm6722-201ENSMUST00000221586 390 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Mgp-201ENSMUST00000032342 617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Snrpg-201ENSMUST00000089558 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Wdr26-207ENSMUST00000162819 6619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm43447-201ENSMUST00000198471 1535 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 M6pr-202ENSMUST00000112610 2539 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Pltp-202ENSMUST00000109316 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Spata7-203ENSMUST00000101146 1913 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Il20ra-201ENSMUST00000020185 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Dnajb12-205ENSMUST00000147914 3041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rufy2-203ENSMUST00000122231 2664 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Las1l-202ENSMUST00000113864 2581 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm25063-201ENSMUST00000104666 94 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Camk1d-202ENSMUST00000114987 1295 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Rnf181-212ENSMUST00000154098 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 9330179D12Rik-201ENSMUST00000180569 1105 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Rb1cc1Q9ESK9 Gm28166-201ENSMUST00000187637 620 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
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