Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCK3

Tspan4, Tetraspanin-4, mousemouse

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Length 238 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
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Tspan4Q9DCK3 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Cdip1-203ENSMUST00000118703 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 LMLN2-201ENSMUST00000224691 2342 ntAPPRIS P5 BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 4930519G04Rik-201ENSMUST00000031547 2092 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.61□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ttc23l-201ENSMUST00000022857 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 3425401B19Rik-201ENSMUST00000096038 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Tmem254a-204ENSMUST00000185006 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Gnb1l-202ENSMUST00000090086 3549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Slc6a18-210ENSMUST00000223074 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Pcdhgb4-202ENSMUST00000195363 4665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.6□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Nradd-201ENSMUST00000035069 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
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Tspan4Q9DCK3 Misp-201ENSMUST00000046833 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Slc36a4-201ENSMUST00000061568 6539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Ldha-202ENSMUST00000048209 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Akt2-201ENSMUST00000051356 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Tyw1-203ENSMUST00000100662 1867 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 AC126549.2-201ENSMUST00000223997 1976 ntBASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Kalrn-206ENSMUST00000114954 4677 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Snx29-203ENSMUST00000122168 2096 ntTSL 5 BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Grik2-210ENSMUST00000220263 2085 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 BB123696-201ENSMUST00000222580 2056 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Siglec1-203ENSMUST00000110227 5790 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Flicr-201ENSMUST00000144719 3455 ntTSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Tpx2-201ENSMUST00000028969 3654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.59□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Syt7-204ENSMUST00000223586 1344 ntBASIC10.58□□□□□ -0.71
Tspan4Q9DCK3 Gale-201ENSMUST00000102540 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Smpd2-201ENSMUST00000019965 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
Tspan4Q9DCK3 Cd247-201ENSMUST00000005907 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.58□□□□□ -0.72
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