Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCB1

Hmgn3, High mobility group nucleosome-binding domain-containing protein 3, mousemouse

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Length 99 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hmgn3Q9DCB1 Etfrf1-204ENSMUST00000111723 842 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 1700003M07Rik-202ENSMUST00000147634 564 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pkig-209ENSMUST00000164399 983 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm17837-201ENSMUST00000186435 985 ntBASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm44081-201ENSMUST00000204406 643 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 B9d2-203ENSMUST00000205658 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm38948-201ENSMUST00000210035 688 ntTSL 3 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 0610005C13Rik-209ENSMUST00000211209 974 ntTSL 2 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Vsig2-204ENSMUST00000215271 891 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Nudt22-201ENSMUST00000041686 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Il22ra1-201ENSMUST00000102546 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pnma5-202ENSMUST00000114540 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Abcb8-201ENSMUST00000073076 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Ifnar1-201ENSMUST00000023689 3909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Grhl2-201ENSMUST00000022895 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm10406-202ENSMUST00000170738 1955 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Eif5a2-201ENSMUST00000060500 5027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm19792-201ENSMUST00000222522 2021 ntTSL 5 BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pfkfb3-220ENSMUST00000192949 4801 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Slc25a13-203ENSMUST00000188414 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Rnf17-201ENSMUST00000095793 5264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Nrros-202ENSMUST00000115163 3559 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Ippk-201ENSMUST00000021817 2856 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Mical1-202ENSMUST00000099934 3292 ntTSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Trpv3-201ENSMUST00000049676 5835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.77□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Zfp108-203ENSMUST00000206777 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm12968-201ENSMUST00000138291 1454 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pmaip1-201ENSMUST00000025399 2646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Fuk-201ENSMUST00000041382 3838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Cyb561d1-202ENSMUST00000106654 1914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Dgcr8-201ENSMUST00000009321 4320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Galnt10-201ENSMUST00000066987 4715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pex26-201ENSMUST00000088561 4093 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Sez6l2-201ENSMUST00000106332 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Tctn3-203ENSMUST00000135795 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Picalm-213ENSMUST00000208742 3361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Polr2i-202ENSMUST00000108192 508 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm13223-201ENSMUST00000118609 747 ntBASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Rpl9-203ENSMUST00000120094 680 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm36536-201ENSMUST00000194241 959 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm42196-201ENSMUST00000209618 730 ntTSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm34466-201ENSMUST00000222218 505 ntTSL 2 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Rsph1-201ENSMUST00000024832 1164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Lcn5-201ENSMUST00000028306 696 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Leap2-201ENSMUST00000036045 531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Eif2s1-201ENSMUST00000071230 3405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm26510-201ENSMUST00000180468 1796 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Lrrc74b-203ENSMUST00000100123 2231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Tti2-202ENSMUST00000209851 3133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Dnmt1-203ENSMUST00000178110 5870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Myh6-205ENSMUST00000226297 6008 ntAPPRIS P1 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Map4-205ENSMUST00000165876 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Zcchc11-202ENSMUST00000097925 5865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm15587-201ENSMUST00000146326 3493 ntTSL 1 (best) BASIC11.76□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Spop-201ENSMUST00000107722 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pde4c-207ENSMUST00000224874 3099 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 AC154404.1-201ENSMUST00000223601 2077 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Slc9a1-201ENSMUST00000030669 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Bpifa6-201ENSMUST00000109753 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Samd11-201ENSMUST00000179919 2610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Cntnap1-201ENSMUST00000103109 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Nol4-204ENSMUST00000097651 4549 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Mei1-201ENSMUST00000089178 3974 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm29358-201ENSMUST00000186510 1734 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pik3r1-202ENSMUST00000055518 7113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Ctdspl2-201ENSMUST00000036647 5053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Commd6-201ENSMUST00000100339 1090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm26953-206ENSMUST00000212840 619 ntTSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm7775-201ENSMUST00000218871 853 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Haus1-201ENSMUST00000048192 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 6430531B16Rik-201ENSMUST00000097970 1161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pdxk-201ENSMUST00000041616 5124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Ctsd-201ENSMUST00000066401 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Gm37324-201ENSMUST00000194500 4504 ntBASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 4833420G17Rik-204ENSMUST00000225186 2627 ntAPPRIS P1 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Pcnx2-201ENSMUST00000047239 7236 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Iqsec2-201ENSMUST00000096275 5252 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Kifap3-202ENSMUST00000077642 4012 ntTSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Cpa5-201ENSMUST00000062758 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
Hmgn3Q9DCB1 Hoxc5-201ENSMUST00000001709 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.75□□□□□ -0.53
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