Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB28

Pop5, Ribonuclease P/MRP protein subunit POP5, mousemouse

Predictions only

Length 169 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pop5Q9DB28 Adamts5-201ENSMUST00000023611 8091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Itgal-202ENSMUST00000117762 5222 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Anks1b-221ENSMUST00000182786 3042 ntTSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Asrgl1-201ENSMUST00000049948 4195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Polrmt-201ENSMUST00000020580 3755 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gnai3-201ENSMUST00000000001 3262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Fxr1-204ENSMUST00000197694 2129 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Pde4d-201ENSMUST00000074103 2167 ntTSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Epb41l2-207ENSMUST00000218903 4115 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Sh3bp2-201ENSMUST00000067638 2885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.01□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm44806-201ENSMUST00000205574 2303 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Acnat2-201ENSMUST00000081541 1664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Hdac10-201ENSMUST00000082197 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Atg7-212ENSMUST00000182902 2543 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gsdme-201ENSMUST00000031845 2502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Pla2g3-202ENSMUST00000064265 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Asph-207ENSMUST00000108333 2652 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Kdm2b-203ENSMUST00000086200 4999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Tmem266-202ENSMUST00000085754 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Accs-201ENSMUST00000041593 2036 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 E2f7-209ENSMUST00000174857 2865 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dnm1-202ENSMUST00000091089 3764 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Rps8-201ENSMUST00000102696 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Rhox2d-201ENSMUST00000115179 685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm11751-201ENSMUST00000126187 460 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Nme9-202ENSMUST00000163199 1196 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ccdc70-201ENSMUST00000017193 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm27486-201ENSMUST00000184923 80 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm6473-201ENSMUST00000188572 1210 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Srgn-201ENSMUST00000020271 938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm45384-201ENSMUST00000210451 277 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Sertad1-201ENSMUST00000008528 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Usmg5-201ENSMUST00000096014 341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Cald1-205ENSMUST00000115027 4777 ntTSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Acsm4-201ENSMUST00000047045 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Emd-202ENSMUST00000088313 1338 ntTSL 2 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Otop1-201ENSMUST00000063136 3106 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 1700001L05Rik-201ENSMUST00000100370 2270 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Clspn-201ENSMUST00000048391 5027 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Usp20-201ENSMUST00000061544 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Hhipl2-202ENSMUST00000192527 2310 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Tbkbp1-204ENSMUST00000107615 3333 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Cyp27b1-201ENSMUST00000165764 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Nubp2-201ENSMUST00000044252 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Serpina11-201ENSMUST00000074693 1447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Txndc5-203ENSMUST00000160653 2586 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Nudt18-202ENSMUST00000228554 3619 ntBASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Spast-201ENSMUST00000024869 4672 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gnb4-205ENSMUST00000155737 5997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ptpn14-202ENSMUST00000097442 10746 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dnaic2-201ENSMUST00000069325 2874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Ccpg1-208ENSMUST00000150826 2939 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Spata33-208ENSMUST00000212892 2940 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Krit1-201ENSMUST00000080085 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Rbfox2-202ENSMUST00000111581 3072 ntTSL 1 (best) BASIC12□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Krba1-202ENSMUST00000077093 8380 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Dbf4-204ENSMUST00000168500 2000 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Fbxl12-201ENSMUST00000086458 2056 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Sh3kbp1-206ENSMUST00000112456 7317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Pdp1-203ENSMUST00000108297 4201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Tcp10b-202ENSMUST00000116666 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Slco3a1-202ENSMUST00000098371 2709 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Adamts1-201ENSMUST00000023610 4884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Rabepk-207ENSMUST00000145903 2968 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm9530-201ENSMUST00000181160 3281 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Bcar3-201ENSMUST00000029766 3311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Tcf12-218ENSMUST00000184783 3489 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Emd-204ENSMUST00000119197 768 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm11630-201ENSMUST00000152825 382 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Spata3-210ENSMUST00000153247 884 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm26927-201ENSMUST00000182385 965 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm34866-201ENSMUST00000196146 515 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm43597-201ENSMUST00000201650 1057 ntTSL 3 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Slc10a7-204ENSMUST00000209992 939 ntTSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm45930-201ENSMUST00000221330 292 ntBASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 AC159619.3-201ENSMUST00000222694 473 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Upk2-201ENSMUST00000047740 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm10131-201ENSMUST00000080152 736 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Sprr2a2-202ENSMUST00000090871 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Tmem97-201ENSMUST00000103242 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Asxl1-205ENSMUST00000227428 6981 ntAPPRIS ALT2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Syngr2-202ENSMUST00000120928 1402 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm10371-201ENSMUST00000127429 1411 ntTSL 2 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Gm34370-201ENSMUST00000209385 1410 ntTSL 5 BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Skp1a-201ENSMUST00000037324 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
Pop5Q9DB28 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.99□□□□□ -0.49
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