Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9N2

Cldn34b2, Claudin 34B2, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn34b2Q9D9N2 Efr3a-205ENSMUST00000173858 2848 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Dbn1-201ENSMUST00000021950 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Msh4-201ENSMUST00000005630 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Runx1t1-204ENSMUST00000105566 6090 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ero1lb-201ENSMUST00000071973 4239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 H2-T22-203ENSMUST00000080015 1761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Duoxa1-202ENSMUST00000110537 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm23270-201ENSMUST00000104055 131 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm15547-201ENSMUST00000122152 333 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28882-201ENSMUST00000185504 314 ntBASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm39929-201ENSMUST00000209672 693 ntTSL 3 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ldha-213ENSMUST00000210631 685 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm39185-201ENSMUST00000212941 540 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 4930447K03Rik-201ENSMUST00000222745 1033 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ctrb1-201ENSMUST00000034435 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ptgr2-208ENSMUST00000147363 1869 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 C130026L21Rik-201ENSMUST00000064930 2472 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm6034-201ENSMUST00000097331 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Bace1-201ENSMUST00000034591 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Capn5-202ENSMUST00000107112 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Hipk3-201ENSMUST00000028600 7454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 2610507I01Rik-201ENSMUST00000154354 1360 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Trpm1-219ENSMUST00000206314 2323 ntTSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp429-201ENSMUST00000109732 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sipa1l3-207ENSMUST00000182484 2420 ntTSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ppfia4-201ENSMUST00000168515 6067 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ebf1-202ENSMUST00000101326 3422 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr95-202ENSMUST00000216318 4917 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.39□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Lin28a-201ENSMUST00000051674 3505 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Rgs12-201ENSMUST00000030984 5472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Urgcp-204ENSMUST00000120306 3972 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Arfgap1-204ENSMUST00000108861 1885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 1810032O08Rik-201ENSMUST00000106378 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 C030034I22Rik-202ENSMUST00000188481 4231 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Oxa1l-201ENSMUST00000000985 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tbc1d14-205ENSMUST00000136189 4436 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm22323-201ENSMUST00000103832 109 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ifna7-201ENSMUST00000105143 573 ntAPPRIS P1 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14832-201ENSMUST00000121289 322 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm20482-202ENSMUST00000174729 825 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm9630-201ENSMUST00000178304 885 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 1700040D17Rik-201ENSMUST00000181305 998 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 6530403H02Rik-204ENSMUST00000183276 659 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm37259-201ENSMUST00000193903 849 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Vmo1-201ENSMUST00000021179 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm39318-201ENSMUST00000214606 1118 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Hspb2-202ENSMUST00000217159 552 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 CT009486.1-201ENSMUST00000222047 661 ntTSL 3 BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tnfrsf4-201ENSMUST00000030952 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Fmr1nb-202ENSMUST00000071848 842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Cd37-202ENSMUST00000098461 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Dgcr14-201ENSMUST00000003621 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Prickle1-202ENSMUST00000109255 4144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm45342-201ENSMUST00000210903 1363 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Glo1-201ENSMUST00000024823 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Hexim2-201ENSMUST00000062530 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm4864-201ENSMUST00000219894 1461 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm5884-201ENSMUST00000036712 1479 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm38355-201ENSMUST00000192514 1570 ntBASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Stau2-214ENSMUST00000162007 2964 ntTSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ppm1g-201ENSMUST00000031032 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Nek1-209ENSMUST00000211672 5109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Alox12b-201ENSMUST00000036424 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Esam-201ENSMUST00000002011 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Wisp1-201ENSMUST00000005255 5097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Pcdha2-202ENSMUST00000195590 4645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.38□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Proser3-202ENSMUST00000108165 2466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Proser3-206ENSMUST00000215288 2465 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Scube1-203ENSMUST00000076060 3913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Fancc-201ENSMUST00000073029 3165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Zfp1-203ENSMUST00000212072 1930 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Tktl2-201ENSMUST00000002025 2021 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Trmt1-203ENSMUST00000109767 2138 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm14342-201ENSMUST00000137629 2119 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Chrna3-201ENSMUST00000034851 4358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Bcl6-201ENSMUST00000023151 3525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv8-9-201ENSMUST00000103533 301 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Ighv8-13-201ENSMUST00000103542 303 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm11930-201ENSMUST00000117788 190 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Sncb-202ENSMUST00000134110 722 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm24845-201ENSMUST00000158034 109 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm16339-201ENSMUST00000160954 929 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Fez1-208ENSMUST00000163816 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm27320-201ENSMUST00000184892 109 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm28379-201ENSMUST00000186450 554 ntTSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Pex1-208ENSMUST00000195894 528 ntTSL 3 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Snhg8-203ENSMUST00000199645 528 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Gm30459-201ENSMUST00000206203 1193 ntTSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Fam168a-210ENSMUST00000216021 968 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.37□□□□□ -0.43
Cldn34b2Q9D9N2 Olfr368-201ENSMUST00000053990 985 ntAPPRIS P1 BASIC12.37□□□□□ -0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.6 ms