Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8U8

Snx5, Sorting nexin-5, mousemouse

Predictions only

Length 404 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx5Q9D8U8 4921530L21Rik-201ENSMUST00000045892 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Itsn2-211ENSMUST00000219007 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm16793-201ENSMUST00000181322 1680 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Slc37a1-202ENSMUST00000171233 2929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Morc3-206ENSMUST00000202261 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Morc3-201ENSMUST00000044068 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rprd1b-203ENSMUST00000109518 4399 ntTSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Nrf1-207ENSMUST00000115206 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gcc1-202ENSMUST00000090511 4650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gstt2-208ENSMUST00000220440 2254 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Fut1-201ENSMUST00000008605 2580 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Zdbf2-202ENSMUST00000114132 12629 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Aldh3a2-202ENSMUST00000074127 3091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Lig3-202ENSMUST00000080461 3056 ntTSL 5 BASIC11.61□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Hmgcl-201ENSMUST00000030432 1418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Art3-208ENSMUST00000121096 1600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mrap2-201ENSMUST00000049457 1931 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gsdme-205ENSMUST00000170142 2133 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Acsf3-201ENSMUST00000015160 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Asb3-202ENSMUST00000117883 2509 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 4833439L19Rik-208ENSMUST00000153065 2502 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Smtn-204ENSMUST00000110011 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Tonsl-207ENSMUST00000168185 4235 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rftn1-202ENSMUST00000113195 2385 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Grm1-203ENSMUST00000105561 4435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Enpp6-202ENSMUST00000119686 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Ccdc42-203ENSMUST00000154294 1384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm6447-201ENSMUST00000118905 835 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mansc4-202ENSMUST00000123367 542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm11508-201ENSMUST00000129337 440 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mroh1-217ENSMUST00000162319 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Lcmt1-204ENSMUST00000206574 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm31545-201ENSMUST00000209358 1219 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Myl6-205ENSMUST00000217969 608 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 AC126408.1-201ENSMUST00000225184 523 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Trem2-201ENSMUST00000024791 1088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Tubgcp6-201ENSMUST00000041656 5357 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 A330093E20Rik-202ENSMUST00000184994 2327 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Coa5-201ENSMUST00000027286 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Myocd-203ENSMUST00000108695 5114 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Plekha6-204ENSMUST00000187285 5040 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gas2l3-207ENSMUST00000220128 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rgr-203ENSMUST00000225070 4704 ntBASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Armc5-201ENSMUST00000044660 3834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Dync1i1-202ENSMUST00000115555 2669 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Slc45a4-201ENSMUST00000054266 4664 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gnas-209ENSMUST00000109088 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Parp9-203ENSMUST00000114878 3548 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gnas-201ENSMUST00000080493 3519 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 1200007C13Rik-201ENSMUST00000143649 2455 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm9008-201ENSMUST00000097218 2353 ntAPPRIS P1 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 L1cam-202ENSMUST00000102871 5113 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Usp16-201ENSMUST00000026710 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm39822-201ENSMUST00000212253 2284 ntTSL 5 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Fam221a-202ENSMUST00000121903 1304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Neat1-202ENSMUST00000174287 3004 ntTSL 1 (best) BASIC11.6□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Yars-201ENSMUST00000106054 2909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rab8a-201ENSMUST00000003121 4550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Chic1-201ENSMUST00000116547 7375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mrpl45-201ENSMUST00000019026 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Golga2-202ENSMUST00000100194 4373 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Lrmp-201ENSMUST00000032396 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Vamp1-201ENSMUST00000032487 2772 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Pcdh10-202ENSMUST00000170695 8234 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rasgef1b-203ENSMUST00000146396 3339 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Mmd2-201ENSMUST00000037048 3317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rnf25-202ENSMUST00000113721 1451 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Pdss2-202ENSMUST00000159139 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Inip-201ENSMUST00000095063 3237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Armcx3-202ENSMUST00000086880 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Cxcl10-202ENSMUST00000118006 1353 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Fgf18-202ENSMUST00000109363 991 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Med28-202ENSMUST00000118833 734 ntTSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm12485-201ENSMUST00000119641 291 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm11400-201ENSMUST00000120853 1214 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Ecscr-204ENSMUST00000133064 1055 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 1700007J10Rik-202ENSMUST00000153431 1111 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 9130024F11Rik-204ENSMUST00000187927 517 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm29608-201ENSMUST00000190444 463 ntBASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm29103-201ENSMUST00000191034 598 ntTSL 5 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm42787-201ENSMUST00000200879 1164 ntTSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gm33337-201ENSMUST00000219594 228 ntTSL 3 BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Gzma-201ENSMUST00000023897 878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Ecscr-201ENSMUST00000097618 1114 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Pag1-201ENSMUST00000108384 3729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Snx5Q9D8U8 Zdhhc20-201ENSMUST00000089473 5186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.59□□□□□ -0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms