Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8P7

Gtf3c6, General transcription factor 3C polypeptide 6, mousemouse

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Length 227 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf3c6Q9D8P7 Cyfip1-201ENSMUST00000032629 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Myo1d-202ENSMUST00000070997 3106 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 C230034O21Rik-201ENSMUST00000153659 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Clmp-201ENSMUST00000034522 4154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sufu-204ENSMUST00000120778 1850 ntTSL 2 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pde2a-202ENSMUST00000166652 3977 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cacna1g-202ENSMUST00000100561 8125 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44089-201ENSMUST00000203624 1930 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gjd4-201ENSMUST00000041007 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dab2ip-206ENSMUST00000112987 6287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm5766-201ENSMUST00000160520 1977 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Hmga1-203ENSMUST00000117600 1635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ncor2-206ENSMUST00000111402 8862 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Defa-ps4-201ENSMUST00000118021 183 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16177-201ENSMUST00000120728 718 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nr2f1-203ENSMUST00000127137 991 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 4930579D09Rik-201ENSMUST00000132321 469 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sumo3-206ENSMUST00000141228 772 ntTSL 3 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Prss51-202ENSMUST00000165710 953 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ucma-204ENSMUST00000167607 785 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rps19-ps13-201ENSMUST00000180504 441 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Lsm7-208ENSMUST00000220225 1129 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 H2-Oa-201ENSMUST00000025192 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Vmn1r8-201ENSMUST00000078186 1213 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm24526-201ENSMUST00000082921 158 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Alg14-201ENSMUST00000039442 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Vasn-201ENSMUST00000038770 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cir1-201ENSMUST00000058615 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm16010-202ENSMUST00000145410 4427 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Kcnj3-201ENSMUST00000067101 5215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Astn1-209ENSMUST00000194369 3344 ntTSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Adamts7-207ENSMUST00000147250 4833 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 1110034G24Rik-202ENSMUST00000110132 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm15897-201ENSMUST00000117770 1486 ntBASIC13.55□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pxdn-202ENSMUST00000122328 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fam160a2-202ENSMUST00000074686 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ackr4-202ENSMUST00000076147 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 H2-T22-201ENSMUST00000058801 1534 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Uspl1-205ENSMUST00000121416 3792 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nhlh2-203ENSMUST00000198675 3943 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 4930429D17Rik-201ENSMUST00000198193 1624 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gsn-205ENSMUST00000201185 2607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Olfr322-202ENSMUST00000213232 4632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mirg-208ENSMUST00000182499 3187 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fbn1-201ENSMUST00000028633 9847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2ae-201ENSMUST00000102969 704 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Folr1-205ENSMUST00000106986 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Blvrb-202ENSMUST00000108357 782 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 H2afb1-201ENSMUST00000122446 348 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pelp1-202ENSMUST00000135148 562 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Snhg17-206ENSMUST00000152125 1046 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem205-202ENSMUST00000178988 862 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm27682-201ENSMUST00000183930 110 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm38092-201ENSMUST00000195600 653 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tyms-ps-201ENSMUST00000219550 915 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl28-201ENSMUST00000032597 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Hist1h2ah-201ENSMUST00000091742 405 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10322-201ENSMUST00000095646 336 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Usp19-203ENSMUST00000166103 4473 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Prex1-203ENSMUST00000109246 2386 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Fgfr1-201ENSMUST00000084027 5025 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 H2-DMb2-201ENSMUST00000041982 1347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Zfp398-201ENSMUST00000079881 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tesk2-202ENSMUST00000106456 2430 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Slc26a5-201ENSMUST00000030878 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nfatc2-204ENSMUST00000109184 6828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dysf-214ENSMUST00000204354 6432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Mdga1-201ENSMUST00000073556 7566 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Eps15l1-201ENSMUST00000163643 3129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rpl22-208ENSMUST00000188151 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Apol7c-201ENSMUST00000062562 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Iqcc-201ENSMUST00000046675 2639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gtf2i-201ENSMUST00000059042 4455 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Trim29-201ENSMUST00000034511 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Wscd1-201ENSMUST00000021168 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cdk5rap1-203ENSMUST00000109731 2160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Cplx1-201ENSMUST00000046892 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm10578-202ENSMUST00000211070 2876 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Ptpru-203ENSMUST00000105987 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Lzts1-204ENSMUST00000185176 5019 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Exosc2-201ENSMUST00000038474 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Rnf14-201ENSMUST00000072376 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Wasl-201ENSMUST00000031695 4352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Tmem181a-201ENSMUST00000088940 4405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Dync1i1-204ENSMUST00000115559 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
Gtf3c6Q9D8P7 Gm44617-202ENSMUST00000209122 2763 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
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