Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8L0

Uncharacterized protein C11orf52 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 127 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D8L0 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Cd300lf-201ENSMUST00000051264 1864 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Taf1b-201ENSMUST00000075954 2209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Racgap1-201ENSMUST00000023756 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Klhdc7b-202ENSMUST00000225666 3951 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Cdnf-201ENSMUST00000036350 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Prkag3-201ENSMUST00000081636 2341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Prps1-201ENSMUST00000033809 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm28590-201ENSMUST00000185679 1609 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Sfn-201ENSMUST00000057311 1613 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ift20-202ENSMUST00000108275 582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm16202-201ENSMUST00000117532 544 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Prkaca-ps1-201ENSMUST00000120823 919 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Abhd11os-201ENSMUST00000136022 604 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Glo1-202ENSMUST00000167624 895 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 B230217C12Rik-204ENSMUST00000170806 1118 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Tmem179-202ENSMUST00000222836 521 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ndufaf2-202ENSMUST00000223734 556 ntBASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Otos-201ENSMUST00000053144 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Clec4g-202ENSMUST00000062037 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Upk3bl-201ENSMUST00000006303 1045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Dbx2-201ENSMUST00000054244 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Cramp1l-201ENSMUST00000073337 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Dcaf8-202ENSMUST00000191689 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 0610040F04Rik-201ENSMUST00000137478 1734 ntTSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Frmd3-201ENSMUST00000084474 4136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mapk4-202ENSMUST00000159162 3514 ntTSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Adora1-202ENSMUST00000086465 4968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Plekhg2-201ENSMUST00000094644 4623 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Frmpd2-203ENSMUST00000208577 5192 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Phykpl-206ENSMUST00000167797 3116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Nrg1-202ENSMUST00000207417 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm26615-201ENSMUST00000181522 3201 ntTSL 2 BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Afg3l1-201ENSMUST00000001520 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.58□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Lax1-201ENSMUST00000169295 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Tram1l1-201ENSMUST00000058994 3889 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Nmral1-203ENSMUST00000115851 1306 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Accs-202ENSMUST00000068513 1872 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Plekhg4-201ENSMUST00000014927 4167 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ripk3-202ENSMUST00000168716 1964 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Esrp1-201ENSMUST00000043781 3743 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm26735-201ENSMUST00000180992 2649 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ppp1r3b-204ENSMUST00000211648 4386 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ccdc89-201ENSMUST00000061391 2093 ntAPPRIS P1 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm21964-203ENSMUST00000219454 1513 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Smim1-208ENSMUST00000143047 3373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Kalrn-201ENSMUST00000076810 8940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Lgi4-201ENSMUST00000039775 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Serpina1f-202ENSMUST00000117053 2830 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Pkp3-201ENSMUST00000066873 2848 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Apold1-201ENSMUST00000167323 3567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Stx18-203ENSMUST00000114126 3002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Zbtb6-202ENSMUST00000112932 5077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Kifc2-201ENSMUST00000004294 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Dsc2-202ENSMUST00000075214 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Olfr1344-202ENSMUST00000218906 2590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mtf2-201ENSMUST00000081567 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Calu-202ENSMUST00000090481 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Asph-212ENSMUST00000108340 6646 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Faap20-202ENSMUST00000105627 710 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm4875-201ENSMUST00000118257 786 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Igfbp4-204ENSMUST00000140772 742 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm15458-201ENSMUST00000156950 709 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm10044-204ENSMUST00000170177 659 ntTSL 3 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm28262-201ENSMUST00000185463 477 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Hapln3-202ENSMUST00000205782 930 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Rbfox2-208ENSMUST00000227930 1218 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ank2-217ENSMUST00000182610 2231 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Immt-203ENSMUST00000114151 2518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Tsc22d3-203ENSMUST00000112996 1552 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Flnc-201ENSMUST00000065090 9038 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Fnbp1-210ENSMUST00000113564 3892 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Hs3st1-202ENSMUST00000117944 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mindy1-202ENSMUST00000107187 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Tmem129-201ENSMUST00000019439 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Tollip-204ENSMUST00000151890 1753 ntTSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Pla2g4f-201ENSMUST00000054651 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Scn8a-208ENSMUST00000200963 5814 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm8206-201ENSMUST00000164139 1956 ntTSL 5 BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm44260-201ENSMUST00000204946 2094 ntBASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Upk3b-201ENSMUST00000062606 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Slc22a4-201ENSMUST00000020586 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gusb-201ENSMUST00000026613 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Dmbt1-202ENSMUST00000208311 6272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gtf2ird1-203ENSMUST00000100650 3487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.57□□□□□ -0.88
Q9D8L0 AC160405.1-201ENSMUST00000218207 1545 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm11494-201ENSMUST00000142279 1738 ntTSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Gm8038-201ENSMUST00000164674 2044 ntBASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Mob4-205ENSMUST00000162364 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.56□□□□□ -0.88
Q9D8L0 Olfr140-202ENSMUST00000111506 3449 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.56□□□□□ -0.88
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 65.9 ms