Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6E4

Ttc9b, Tetratricopeptide repeat protein 9B, mousemouse

Predictions only

Length 239 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc9bQ9D6E4 Rap1gap2-202ENSMUST00000102521 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ifitm10-203ENSMUST00000105988 824 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rs1-202ENSMUST00000112368 731 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Yipf6-202ENSMUST00000113811 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm7722-201ENSMUST00000120646 741 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Asb8-202ENSMUST00000123626 1100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Asb8-203ENSMUST00000123922 1162 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3bos-201ENSMUST00000124988 718 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm16323-201ENSMUST00000134920 556 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm11683-201ENSMUST00000147006 918 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm3948-201ENSMUST00000147795 421 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mocs2-205ENSMUST00000165022 962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm27910-201ENSMUST00000185004 107 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm28686-201ENSMUST00000187404 609 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 1700039I01Rik-201ENSMUST00000194370 479 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 D3Ertd751e-215ENSMUST00000195882 680 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm43156-201ENSMUST00000202338 2127 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Timm10b-210ENSMUST00000209588 373 ntTSL 3 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Acy1-208ENSMUST00000214275 1284 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 1110019B22Rik-202ENSMUST00000218396 989 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 AC129219.2-201ENSMUST00000224324 701 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm9072-201ENSMUST00000218390 1514 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pcdhgb8-202ENSMUST00000208907 2796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mfsd14b-201ENSMUST00000054730 3251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cask-204ENSMUST00000115438 8366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dph7-201ENSMUST00000028351 1666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Lpcat1-201ENSMUST00000022099 3675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cacna2d2-208ENSMUST00000170737 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cdc42se1-201ENSMUST00000053872 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Hsd3b4-201ENSMUST00000179429 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm10681-203ENSMUST00000186215 1575 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ormdl2-201ENSMUST00000026409 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Lzts3-201ENSMUST00000045761 4201 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Acbd5-213ENSMUST00000227809 1986 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 AC158355.1-201ENSMUST00000215895 1705 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm12248-202ENSMUST00000218429 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Vax2os-203ENSMUST00000155159 4063 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm36500-201ENSMUST00000221821 1626 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tcf4-204ENSMUST00000114978 2437 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 4930470G03Rik-201ENSMUST00000122926 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Nckipsd-201ENSMUST00000035218 3360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gpr45-201ENSMUST00000114761 1546 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ssc5d-201ENSMUST00000057612 4348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Stard5-201ENSMUST00000075418 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Hacd4-201ENSMUST00000030221 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Bscl2-203ENSMUST00000159634 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm24231-201ENSMUST00000104315 133 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tsc22d4-204ENSMUST00000110983 1043 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mapkapk5-203ENSMUST00000111782 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm14314-201ENSMUST00000118225 1015 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm14724-201ENSMUST00000118400 537 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pcnp-203ENSMUST00000119981 901 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm11246-201ENSMUST00000120880 345 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mir1901-201ENSMUST00000122616 78 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm15856-201ENSMUST00000124853 1162 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pyy-202ENSMUST00000127381 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cd63-ps-202ENSMUST00000154992 717 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ctdspl-202ENSMUST00000172464 798 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm3671-201ENSMUST00000182463 1007 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mir6998-201ENSMUST00000183343 64 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm28760-202ENSMUST00000190376 481 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 8030442B05Rik-201ENSMUST00000192626 1035 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm44958-201ENSMUST00000203734 736 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm17831-201ENSMUST00000205579 900 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm4157-201ENSMUST00000211647 679 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ms4a8a-201ENSMUST00000025636 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 U2af1l4-201ENSMUST00000043273 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ppp1r2-ps3-201ENSMUST00000078012 627 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm17080-201ENSMUST00000087588 811 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ltbp4-204ENSMUST00000118961 3444 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Prkx-202ENSMUST00000114044 2639 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm21451-201ENSMUST00000111062 2775 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Pcdha1-201ENSMUST00000070797 5248 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Obsl1-201ENSMUST00000113565 3379 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tfe3-211ENSMUST00000137467 3390 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ttc8-202ENSMUST00000085109 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Oxct1-205ENSMUST00000138927 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Phldb1-201ENSMUST00000034611 5461 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gjc1-202ENSMUST00000092567 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mief1-201ENSMUST00000023048 5081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Nphs1os-201ENSMUST00000152625 1339 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Srsf1-205ENSMUST00000139129 5362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rcbtb2-202ENSMUST00000110952 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Dnmt3l-202ENSMUST00000123940 1452 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Mfn2-203ENSMUST00000105715 4043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Capn3-204ENSMUST00000110716 2752 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Sall4-201ENSMUST00000029061 5073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Spock1-205ENSMUST00000187852 3113 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Radil-204ENSMUST00000110785 3708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Knop1-204ENSMUST00000106550 5524 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Rpl15-204ENSMUST00000112598 802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Ttc9bQ9D6E4 Gm15906-201ENSMUST00000124746 323 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55 ms