Protein–RNA interactions for Protein: Q9D174

Ss18l2, SS18-like protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 77 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ss18l2Q9D174 Hadhb-201ENSMUST00000026841 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Ptgdr-201ENSMUST00000095959 3187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gtf2i-210ENSMUST00000173341 4302 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Arnt2-213ENSMUST00000209133 6228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Arfgap2-201ENSMUST00000028691 2791 ntTSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Nrap-203ENSMUST00000095947 5214 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Col6a3-201ENSMUST00000056925 10106 ntTSL 5 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Zbtb42-201ENSMUST00000169593 3478 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Fnip1-201ENSMUST00000046835 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Pcdhga4-201ENSMUST00000194418 4727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm8994-202ENSMUST00000204530 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm14866-201ENSMUST00000149206 2118 ntTSL 2 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Mum1l1-204ENSMUST00000113045 4523 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Rtl5-204ENSMUST00000188731 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Chst4-201ENSMUST00000109222 1942 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.86□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Rab18-201ENSMUST00000097680 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Cit-201ENSMUST00000051704 9514 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Tardbp-206ENSMUST00000105702 6425 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Fancc-217ENSMUST00000163091 2995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Cad-211ENSMUST00000202795 6559 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 4930581F22Rik-201ENSMUST00000093873 2402 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Syt6-203ENSMUST00000118117 1856 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 4933439K11Rik-203ENSMUST00000169111 1869 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Tcf4-252ENSMUST00000202477 1873 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Sorcs1-206ENSMUST00000209783 3489 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Zfp251-201ENSMUST00000080406 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Nrap-204ENSMUST00000166203 5079 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Prkag3-202ENSMUST00000113672 2003 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Ckm-203ENSMUST00000208710 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Pggt1b-201ENSMUST00000025354 2736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm14137-201ENSMUST00000069711 3067 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Glt1d1-201ENSMUST00000118139 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Nhlh2-201ENSMUST00000066187 3761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Aebp2-206ENSMUST00000161335 2524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Serpinf2-202ENSMUST00000108437 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Akap12-201ENSMUST00000045730 6195 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Trp53-202ENSMUST00000108657 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Hoxd10-201ENSMUST00000061745 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Slc12a7-201ENSMUST00000017900 5142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gsdma3-201ENSMUST00000073295 1477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Apol6-206ENSMUST00000149569 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Zmynd8-205ENSMUST00000109266 5072 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Zmynd8-221ENSMUST00000177633 5093 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Pcdhga6-201ENSMUST00000195823 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Myh1-201ENSMUST00000018637 5938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Natd1-201ENSMUST00000019075 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Cox16-202ENSMUST00000110340 668 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Acvr1c-203ENSMUST00000112607 1266 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Rpl9-202ENSMUST00000118543 1193 ntTSL 2 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm5638-201ENSMUST00000118618 1258 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm11795-201ENSMUST00000127180 396 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm15317-201ENSMUST00000129569 699 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Haghl-206ENSMUST00000138759 1074 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Pax8-208ENSMUST00000153601 1226 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Ankrd13d-204ENSMUST00000167215 639 ntTSL 3 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 A430057M04Rik-201ENSMUST00000169054 3835 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm2213-201ENSMUST00000197485 688 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm42863-201ENSMUST00000197875 2958 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Ube2a-205ENSMUST00000201068 1298 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 AC124732.2-201ENSMUST00000221977 316 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Prg3-201ENSMUST00000028466 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Bcdin3d-201ENSMUST00000040313 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Mcf2l-217ENSMUST00000145067 5313 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Ephb6-201ENSMUST00000114732 3762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Vill-203ENSMUST00000126251 1411 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 BC017643-201ENSMUST00000038709 2417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Lamb1-205ENSMUST00000169088 5557 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Satb1-207ENSMUST00000140979 3748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Sema4a-201ENSMUST00000029700 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Esrp1-203ENSMUST00000108311 3864 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Abcg5-201ENSMUST00000066175 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Myh8-201ENSMUST00000019625 6149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Magel2-201ENSMUST00000080403 4631 ntAPPRIS P1 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 AC156031.2-201ENSMUST00000213107 3310 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 AI597479-201ENSMUST00000010434 3458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Calcoco1-201ENSMUST00000023818 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Senp3-201ENSMUST00000005336 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Plekha1-202ENSMUST00000075181 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Snx10-201ENSMUST00000049152 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.85□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Cyth2-208ENSMUST00000211783 1983 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Washc5-201ENSMUST00000022976 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Ppp1r12a-205ENSMUST00000219263 3355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Gm43014-201ENSMUST00000198568 2443 ntBASIC8.84□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Slc6a2-201ENSMUST00000072939 6187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Nt5c3b-203ENSMUST00000107397 1348 ntTSL 1 (best) BASIC8.84□□□□□ -0.99
Ss18l2Q9D174 Smc4-202ENSMUST00000107803 3983 ntTSL 5 BASIC8.84□□□□□ -0.99
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.7 ms