Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0D5

Gtf2e1, General transcription factor IIE subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 440 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gtf2e1Q9D0D5 Mst1-201ENSMUST00000035211 2262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Igfals-201ENSMUST00000050714 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Jhy-201ENSMUST00000034521 3074 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Vapb-201ENSMUST00000067530 7029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ap3d1-201ENSMUST00000020420 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mmgt2-203ENSMUST00000129162 1828 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 BC003331-205ENSMUST00000111913 3273 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Wfdc8-201ENSMUST00000094351 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Foxred2-202ENSMUST00000117725 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Lrp8os2-204ENSMUST00000188737 3078 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Rhox9-202ENSMUST00000170643 2422 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tk1-201ENSMUST00000026661 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Adarb1-201ENSMUST00000020496 6549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ndufa3-202ENSMUST00000108644 351 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Il15ra-204ENSMUST00000114832 468 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11989-201ENSMUST00000117240 672 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11362-201ENSMUST00000118838 850 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Apoe-208ENSMUST00000174191 472 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 AY036118-201ENSMUST00000200021 923 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nsd1-205ENSMUST00000224693 852 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mcm8-201ENSMUST00000028831 3179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Timp3-201ENSMUST00000020234 4722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Prickle3-201ENSMUST00000033485 2301 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Atp6ap1-202ENSMUST00000114171 2157 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Parp16-202ENSMUST00000213396 2518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Bud13-201ENSMUST00000074957 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Tle6-201ENSMUST00000072020 2015 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gsdma2-201ENSMUST00000017355 1314 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm11190-201ENSMUST00000132487 3414 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nudt5-205ENSMUST00000179748 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Itfg2-201ENSMUST00000001559 2320 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Pax6-202ENSMUST00000090397 3069 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ispd-205ENSMUST00000221895 4022 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Sacs-202ENSMUST00000119509 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp346-201ENSMUST00000021937 3333 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr1420-201ENSMUST00000072784 1444 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Ebna1bp2-201ENSMUST00000030501 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Oxr1-203ENSMUST00000090096 4515 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm23949-201ENSMUST00000104027 127 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mkl2-203ENSMUST00000115809 667 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12380-201ENSMUST00000119012 544 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Rpsa-ps12-201ENSMUST00000120596 892 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Rtbdn-203ENSMUST00000121880 1223 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm12690-201ENSMUST00000132108 354 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm5616-201ENSMUST00000165252 384 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm17040-202ENSMUST00000170597 889 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm8741-201ENSMUST00000174736 384 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm27627-201ENSMUST00000183644 150 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Nr1h2-ps-201ENSMUST00000183844 478 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Abracl-204ENSMUST00000220110 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Pfkfb3-213ENSMUST00000171188 2058 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mgat1-202ENSMUST00000101293 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Sec14l5-201ENSMUST00000165810 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Mlxip-201ENSMUST00000068237 7303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gm26593-201ENSMUST00000181848 1970 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Hmg20a-204ENSMUST00000214869 1782 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Polrmt-202ENSMUST00000159016 3535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Hnf1b-203ENSMUST00000108114 2659 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
Gtf2e1Q9D0D5 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Phyhd1-212ENSMUST00000154647 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rph3al-201ENSMUST00000021208 1690 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Sstr5-202ENSMUST00000165183 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 AC241621.2-201ENSMUST00000223991 2151 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Mdk-ps1-201ENSMUST00000119782 321 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Olfr647-ps1-201ENSMUST00000121599 960 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Zfp629-204ENSMUST00000128731 823 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Eloc-207ENSMUST00000187910 620 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm3786-201ENSMUST00000202659 378 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Cacng1-201ENSMUST00000021065 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm18730-201ENSMUST00000218038 343 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm21027-201ENSMUST00000219300 1236 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Tnni3-201ENSMUST00000098859 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Slc16a3-208ENSMUST00000168579 4335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fyttd1-201ENSMUST00000023489 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gm16958-201ENSMUST00000180603 1765 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Spata21-201ENSMUST00000051907 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 AC154262.2-202ENSMUST00000225158 1331 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rp2-202ENSMUST00000115387 4498 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Ilvbl-208ENSMUST00000218875 3020 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Fbxl12-202ENSMUST00000086459 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Elf4-202ENSMUST00000114958 6088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Mthfsd-210ENSMUST00000139782 1366 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Rbbp5-207ENSMUST00000190997 2856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Gramd2-201ENSMUST00000098661 1368 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
Gtf2e1Q9D0D5 Evi5l-202ENSMUST00000176072 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.6 ms