Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXE6

Xrcc3, DNA repair protein XRCC3, mousemouse

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Length 349 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xrcc3Q9CXE6 1520401A03Rik-205ENSMUST00000201734 2660 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Snap23-201ENSMUST00000028743 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.2□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Grip1-205ENSMUST00000105262 4996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm43174-201ENSMUST00000195914 2445 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Pdcd4-202ENSMUST00000074371 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Poll-201ENSMUST00000026239 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rnf214-205ENSMUST00000160699 2287 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Hnrnpf-209ENSMUST00000180020 2280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Oraov1-204ENSMUST00000128057 2231 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rasgef1c-202ENSMUST00000093141 2120 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Hjurp-206ENSMUST00000147393 2030 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Camsap3-205ENSMUST00000207432 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tollip-201ENSMUST00000001950 3788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Sec61g-203ENSMUST00000109643 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Esrp1-204ENSMUST00000108313 3696 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 1300002E11Rik-202ENSMUST00000181780 1650 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Irak2-201ENSMUST00000059286 3196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Olfr1419-203ENSMUST00000217617 3087 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Odf3-202ENSMUST00000106049 1509 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cacna1c-203ENSMUST00000112790 7631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Neu4-201ENSMUST00000050890 4511 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Actc1-201ENSMUST00000090269 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ccdc167-202ENSMUST00000128751 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm18983-201ENSMUST00000222884 2729 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Vsig10l-201ENSMUST00000107977 3836 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cryba4-202ENSMUST00000112383 754 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm12840-201ENSMUST00000156081 627 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Abhd14a-202ENSMUST00000171678 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm21854-201ENSMUST00000179901 471 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Panct2-202ENSMUST00000188631 625 ntTSL 3 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm2756-201ENSMUST00000195851 400 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm8239-201ENSMUST00000204094 444 ntTSL 2 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Jakmip1-215ENSMUST00000212047 1191 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC153506.3-201ENSMUST00000219287 1029 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Sftpa1-201ENSMUST00000022314 851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Olfr272-201ENSMUST00000051600 962 ntAPPRIS P1 BASIC10.19□□□□□ -0.78
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Xrcc3Q9CXE6 AC124577.2-201ENSMUST00000217413 2420 ntBASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Nlrx1-202ENSMUST00000168499 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Slc44a2-201ENSMUST00000034697 3456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ndc1-204ENSMUST00000139560 4584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Eif4a2-223ENSMUST00000168891 2203 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Col6a6-202ENSMUST00000098441 8781 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ctr9-201ENSMUST00000005749 4300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Plekhn1-202ENSMUST00000105571 2004 ntTSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Brap-202ENSMUST00000111765 3861 ntTSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Rtbdn-201ENSMUST00000067472 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tmem268-201ENSMUST00000077709 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Pcdhgb5-201ENSMUST00000192535 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Satb1-208ENSMUST00000144331 6243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Cysltr2-202ENSMUST00000169168 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Ptcd3-201ENSMUST00000082094 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.19□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zic4-204ENSMUST00000172646 2535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Misp-202ENSMUST00000169041 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 A930024N18Rik-201ENSMUST00000181251 3955 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Xrcc3Q9CXE6 Esr1-201ENSMUST00000067086 4344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Xrcc3Q9CXE6 Ehbp1l1-202ENSMUST00000075606 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Mfap3l-203ENSMUST00000161421 4142 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Syvn1-207ENSMUST00000156550 3363 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Crkl-201ENSMUST00000006293 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Arhgap29-201ENSMUST00000037958 5787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Xrcc3Q9CXE6 Ppdpf-202ENSMUST00000108841 689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 R3hdml-201ENSMUST00000109416 1094 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Xrcc3Q9CXE6 Gm11851-201ENSMUST00000132219 692 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Dlx1as-202ENSMUST00000137251 647 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 4933427I22Rik-201ENSMUST00000138672 393 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm27390-201ENSMUST00000184516 176 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
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Xrcc3Q9CXE6 Gm42846-201ENSMUST00000201771 514 ntTSL 3 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gm35368-201ENSMUST00000209554 1244 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Galc-201ENSMUST00000021390 3832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC122305.4-201ENSMUST00000216159 1206 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC159263.1-201ENSMUST00000220746 482 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC173210.1-201ENSMUST00000222341 1131 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 1700019N19Rik-201ENSMUST00000028299 970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Tex12-201ENSMUST00000034568 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Myoz3-201ENSMUST00000056533 870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Lyzl4-201ENSMUST00000077706 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Lrfn5-201ENSMUST00000055815 4410 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Zranb2-201ENSMUST00000029831 2540 ntTSL 5 BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Gstt3-201ENSMUST00000001715 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 AC154517.2-201ENSMUST00000220829 2458 ntBASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Chit1-202ENSMUST00000159963 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
Xrcc3Q9CXE6 Mfsd4b5-203ENSMUST00000164566 2372 ntTSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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Xrcc3Q9CXE6 Ankrd52-201ENSMUST00000014642 6620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.18□□□□□ -0.78
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