Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 1700030C14Rik-201ENSMUST00000139912 756 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm14285-201ENSMUST00000146049 380 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 1700015O11Rik-201ENSMUST00000180964 678 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm9728-201ENSMUST00000200197 1055 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm44124-201ENSMUST00000204159 472 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm45484-201ENSMUST00000210310 1141 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 AC153962.4-201ENSMUST00000217878 242 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 AC152453.1-201ENSMUST00000218802 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Oit1-201ENSMUST00000022269 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 AC022775.2-201ENSMUST00000227885 646 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mrto4-201ENSMUST00000030513 930 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Pcdhgc3-201ENSMUST00000076807 4687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Plch2-206ENSMUST00000135665 4349 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Cep41-203ENSMUST00000115131 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Plcg1-203ENSMUST00000109462 5107 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Sun2-203ENSMUST00000100439 3768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Podn-202ENSMUST00000106708 2947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Etl4-201ENSMUST00000045555 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm37105-201ENSMUST00000192251 2085 ntBASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Col14a1-203ENSMUST00000110221 5679 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ube2a-201ENSMUST00000016452 1732 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Setd1a-202ENSMUST00000047157 5927 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Mei4-201ENSMUST00000057067 2670 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Olfr649-202ENSMUST00000106859 1382 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rita1-207ENSMUST00000177800 1668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.93□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Dis3l-208ENSMUST00000168844 3575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ripk4-202ENSMUST00000113743 3743 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5b-207ENSMUST00000113974 4150 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tnfrsf22-203ENSMUST00000146692 2298 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Trpc7-208ENSMUST00000174457 2424 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ltbp2-203ENSMUST00000163189 6470 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Sin3a-208ENSMUST00000168678 5206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Dlk1-204ENSMUST00000109843 1300 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Art3-204ENSMUST00000119587 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tgfbr1-202ENSMUST00000044234 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Epha5-204ENSMUST00000113401 5158 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Herc4-208ENSMUST00000219577 3914 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Adam32-201ENSMUST00000119720 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ppara-203ENSMUST00000109423 2519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Grid1-201ENSMUST00000043349 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm23931-201ENSMUST00000103842 109 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Fgf8-203ENSMUST00000111924 630 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 9230102O04Rik-201ENSMUST00000114915 528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Nfyc-203ENSMUST00000118902 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm15853-201ENSMUST00000160268 556 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 2010320O07Rik-201ENSMUST00000160935 525 ntTSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm16282-201ENSMUST00000162641 451 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Dcdc2b-203ENSMUST00000179209 864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 1190007I07Rik-205ENSMUST00000185168 469 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm43438-201ENSMUST00000198133 379 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm5149-201ENSMUST00000199768 620 ntTSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Wfdc1-202ENSMUST00000212901 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm32025-201ENSMUST00000217960 307 ntBASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tatdn3-201ENSMUST00000027945 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Catsper4-201ENSMUST00000055892 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Prkca-201ENSMUST00000059595 8409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rhbdd2-201ENSMUST00000043707 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ercc4-201ENSMUST00000023206 3480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Recql-201ENSMUST00000032370 2112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Olfr707-203ENSMUST00000210644 1817 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 1110002L01Rik-202ENSMUST00000168012 3569 ntTSL 2 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rabggtb-201ENSMUST00000089950 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Zscan10-202ENSMUST00000115509 2368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ky-201ENSMUST00000039390 5837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.92□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Suox-201ENSMUST00000054764 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Slc36a1-202ENSMUST00000108867 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ubtf-203ENSMUST00000107115 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Dnd1-201ENSMUST00000061522 1451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Cacna1g-208ENSMUST00000107790 8035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Myocd-201ENSMUST00000101042 2585 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm9866-202ENSMUST00000182473 1882 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Hmox2-201ENSMUST00000004172 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Myh3-201ENSMUST00000007301 5992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Napsa-201ENSMUST00000002274 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Slc8a2-201ENSMUST00000168693 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Specc1-212ENSMUST00000202178 2932 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Steap3-202ENSMUST00000112640 2752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Tcf4-254ENSMUST00000202674 2615 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Adgrl1-204ENSMUST00000131717 5152 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Ighv7-3-201ENSMUST00000103461 361 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Qdpr-203ENSMUST00000118097 1232 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm14921-201ENSMUST00000118643 908 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Rpl19-ps12-201ENSMUST00000121251 591 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 U2af1l4-215ENSMUST00000166257 546 ntTSL 5 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm25927-201ENSMUST00000175058 117 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm37424-201ENSMUST00000191727 561 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm4935-201ENSMUST00000221316 1198 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 AC154305.4-201ENSMUST00000224520 614 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Prss2-201ENSMUST00000070380 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Olfr91-201ENSMUST00000087144 939 ntAPPRIS P1 BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Gm38157-201ENSMUST00000194178 1698 ntBASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 1110032A03Rik-201ENSMUST00000042468 2082 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Tdrd12Q9CWU0 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC12.91□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40.5 ms