Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWM4

Pfdn1, Prefoldin subunit 1, mousemouse

Predictions only

Length 122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pfdn1Q9CWM4 Lcor-201ENSMUST00000067795 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Sash3-201ENSMUST00000033427 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Chmp5-201ENSMUST00000030128 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Fam110b-201ENSMUST00000054857 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pdzd7-203ENSMUST00000169459 3903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Wbp1l-202ENSMUST00000111855 3865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Mbd3-202ENSMUST00000105347 914 ntTSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ngb-202ENSMUST00000110176 908 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a51-203ENSMUST00000132815 1005 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Dap-204ENSMUST00000186425 597 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 AC138604.1-201ENSMUST00000226969 739 ntBASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pnmt-201ENSMUST00000041301 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Prr29-201ENSMUST00000009354 1112 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Magi1-203ENSMUST00000093769 4598 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tmprss5-202ENSMUST00000165088 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Crispld2-201ENSMUST00000034282 2898 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Snx13-202ENSMUST00000163677 3681 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tmem92-201ENSMUST00000100554 2043 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Patl1-201ENSMUST00000061618 4221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rin1-201ENSMUST00000025818 4184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ep400-202ENSMUST00000112433 3399 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pnma2-201ENSMUST00000089236 5518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Alg13-202ENSMUST00000070801 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Fsd2-201ENSMUST00000042318 3985 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Olfr582-202ENSMUST00000210119 1787 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Kirrel3-209ENSMUST00000190549 3074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pik3r5-201ENSMUST00000021283 4370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm38901-201ENSMUST00000202448 3008 ntTSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Son-202ENSMUST00000114037 8399 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gphb5-201ENSMUST00000051079 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.95□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Irak4-201ENSMUST00000074936 2831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tm9sf1-202ENSMUST00000120041 2164 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tcf4-226ENSMUST00000201094 2172 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Apol9b-201ENSMUST00000109775 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ppargc1b-201ENSMUST00000063307 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Vwa5b2-202ENSMUST00000096197 4527 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Arfgap1-202ENSMUST00000108859 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Olfr482-202ENSMUST00000217304 2612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ptbp1-202ENSMUST00000095457 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Fntb-206ENSMUST00000137826 1442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 2600006K01Rik-201ENSMUST00000047607 1406 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ush1c-201ENSMUST00000009667 3072 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Mettl27-203ENSMUST00000111218 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 AC154314.2-201ENSMUST00000223677 3502 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Nrf1-209ENSMUST00000115209 2406 ntTSL 5 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 4933417C20Rik-201ENSMUST00000193962 1874 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pbx1-208ENSMUST00000188912 3970 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rnf170-201ENSMUST00000014022 3929 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rps6kl1-202ENSMUST00000221972 2881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ndufb6-202ENSMUST00000108108 480 ntTSL 3 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm11752-201ENSMUST00000143291 510 ntTSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm19184-201ENSMUST00000196798 928 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm45453-201ENSMUST00000211758 853 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 AC149588.3-201ENSMUST00000227515 150 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rpp21-201ENSMUST00000025319 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Hist1h2ak-201ENSMUST00000074752 393 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Olfr520-201ENSMUST00000098264 951 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Wwox-203ENSMUST00000109108 1771 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Atg14-202ENSMUST00000226299 3729 ntAPPRIS P1 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Dhx34-201ENSMUST00000094816 4073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pja1-204ENSMUST00000113797 1676 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Gm17230-201ENSMUST00000171194 3942 ntBASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Srrt-212ENSMUST00000199243 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Plekha7-201ENSMUST00000084664 4312 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ncapd2-201ENSMUST00000043848 4629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ces2a-201ENSMUST00000034346 1960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 4930488L21Rik-201ENSMUST00000181864 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.94□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Fggy-202ENSMUST00000079223 1891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Ntrk2-207ENSMUST00000225488 4706 ntAPPRIS P1 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Slc31a2-201ENSMUST00000084530 1820 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Slc25a22-223ENSMUST00000201710 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Nrde2-201ENSMUST00000021596 3718 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Zcchc7-203ENSMUST00000107824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Becn1-205ENSMUST00000130916 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Pde9a-201ENSMUST00000047168 2065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Lsg1-201ENSMUST00000117363 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Lig4-201ENSMUST00000095476 5028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Tln2-205ENSMUST00000215267 4999 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 5033428I22Rik-201ENSMUST00000181638 2040 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Capn15-204ENSMUST00000212149 4555 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Vwa5b1-201ENSMUST00000030533 7486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Arfrp1-202ENSMUST00000108808 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Pfdn1Q9CWM4 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.93□□□□□ -0.66
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms