Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWB5

Pgpep1l, Pyroglutamyl-peptidase 1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pgpep1lQ9CWB5 Pnkp-201ENSMUST00000003044 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Dhx57-202ENSMUST00000086555 5077 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Cflar-202ENSMUST00000097722 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Lrrfip1-202ENSMUST00000068167 2849 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Wdr45-204ENSMUST00000115689 1568 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Zkscan4-201ENSMUST00000062609 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Klk1b16-201ENSMUST00000005933 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ccdc25-201ENSMUST00000022614 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.52□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Arhgap35-202ENSMUST00000171937 6251 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gan-201ENSMUST00000064488 2652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Amz2-203ENSMUST00000103061 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm14703-201ENSMUST00000145894 1820 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Adam32-202ENSMUST00000121438 2450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Dlgap3-203ENSMUST00000106094 4207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Clec16a-205ENSMUST00000115827 2949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm26635-201ENSMUST00000181077 3199 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Pmp2-201ENSMUST00000029034 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Nup98-201ENSMUST00000070165 4052 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Steap2-201ENSMUST00000015797 3657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Dio1-201ENSMUST00000082426 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Alg2-201ENSMUST00000044148 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Mtmr3-201ENSMUST00000040448 5534 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Hsp90b1-201ENSMUST00000020238 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Henmt1-205ENSMUST00000196533 1491 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Map3k20-201ENSMUST00000090824 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Tekt3-201ENSMUST00000035732 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ace-202ENSMUST00000001964 2418 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Tm2d3-203ENSMUST00000107495 1003 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Rpl36-ps10-201ENSMUST00000117431 216 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Zfp36l1-ps-201ENSMUST00000118349 899 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ankrd29-202ENSMUST00000122408 850 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm15884-201ENSMUST00000143765 643 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm23119-201ENSMUST00000158610 140 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm38304-201ENSMUST00000161826 600 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Snrpa-206ENSMUST00000163311 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm5523-201ENSMUST00000180415 997 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 2810405F17Rik-201ENSMUST00000189334 1117 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm34728-201ENSMUST00000201510 414 ntTSL 3 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm44100-201ENSMUST00000204329 436 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm44968-201ENSMUST00000207652 1171 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm17827-201ENSMUST00000211825 742 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 AC153974.2-201ENSMUST00000218577 1025 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 AC158523.3-201ENSMUST00000220664 864 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Il17c-201ENSMUST00000050963 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Phactr3-204ENSMUST00000108916 2656 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Sufu-203ENSMUST00000118440 2663 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm44891-201ENSMUST00000208817 2223 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Rorc-204ENSMUST00000200009 1543 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 C130012C08Rik-201ENSMUST00000194287 3665 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Slc39a3-201ENSMUST00000059551 3680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Slc6a18-208ENSMUST00000222029 2005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 B430305J03Rik-201ENSMUST00000066298 3702 ntAPPRIS P1 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm5847-201ENSMUST00000178959 1595 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Odf2-203ENSMUST00000113755 2305 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Rad9b-202ENSMUST00000117263 2371 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Dlgap1-208ENSMUST00000135938 2895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Acot6-202ENSMUST00000222921 3622 ntBASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Dusp19-201ENSMUST00000028384 1632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Txndc12-201ENSMUST00000030296 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 F7-201ENSMUST00000033820 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Etv6-202ENSMUST00000111963 5707 ntTSL 1 (best) BASIC10.51□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Fitm2-201ENSMUST00000109418 3967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm37437-201ENSMUST00000194451 1937 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Tmem163-205ENSMUST00000185560 3488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Dnaaf5-201ENSMUST00000026975 3450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 H2-T10-202ENSMUST00000174382 1699 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Pdcd6ip-202ENSMUST00000111861 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Spata48-201ENSMUST00000020410 1430 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Atg2b-201ENSMUST00000041055 7546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Tbc1d22b-201ENSMUST00000048677 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Sh3glb2-202ENSMUST00000100215 1749 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Med8-204ENSMUST00000106384 1743 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Nrxn1-202ENSMUST00000072671 8118 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 2310007B03Rik-201ENSMUST00000043718 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Elp5-201ENSMUST00000108594 1454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Trim50-202ENSMUST00000111180 1456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ppp1r12b-209ENSMUST00000168381 3621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Sp2-201ENSMUST00000062652 2367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm13611-201ENSMUST00000118269 318 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Dusp13-204ENSMUST00000120984 976 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm11450-201ENSMUST00000121144 333 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Mir1943-201ENSMUST00000158276 73 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm15852-201ENSMUST00000159701 915 ntTSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm24514-201ENSMUST00000174961 285 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Chtf8-203ENSMUST00000176090 615 ntTSL 5 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Lsm10-203ENSMUST00000179323 808 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Mir7677-201ENSMUST00000184226 67 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ighv4-2-201ENSMUST00000192975 362 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm33222-201ENSMUST00000193725 654 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Gm7207-201ENSMUST00000211575 1067 ntBASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ggps1-204ENSMUST00000221713 667 ntTSL 3 BASIC10.5□□□□□ -0.73
Pgpep1lQ9CWB5 Ppie-201ENSMUST00000030404 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.5□□□□□ -0.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.1 ms