Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ10

Chmp3, Charged multivesicular body protein 3, mousemouse

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Length 224 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp3Q9CQ10 Plekhg6-201ENSMUST00000042647 3299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Add2-203ENSMUST00000203279 1454 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Car6-201ENSMUST00000030817 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm19385-201ENSMUST00000214714 1813 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Olfr71-202ENSMUST00000107862 2587 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Arfip1-201ENSMUST00000098990 2799 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Amer2-201ENSMUST00000022561 10506 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rps19-ps11-201ENSMUST00000160308 433 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 C030017D09Rik-201ENSMUST00000163690 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm44967-201ENSMUST00000207047 631 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm35082-202ENSMUST00000208164 525 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm45892-201ENSMUST00000212627 273 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm39404-201ENSMUST00000216350 313 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm8712-201ENSMUST00000221090 701 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 AC125209.1-201ENSMUST00000225812 766 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cct6a-202ENSMUST00000201414 2454 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13003-201ENSMUST00000151040 2904 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Tmem104-202ENSMUST00000100235 4561 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pphln1-202ENSMUST00000068457 3816 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Nin-204ENSMUST00000169074 6636 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Col14a1-202ENSMUST00000110217 6457 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Prkcsh-201ENSMUST00000003493 2012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 4930528D03Rik-203ENSMUST00000225577 1348 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Eif4ebp2-202ENSMUST00000167087 1422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cngb1-202ENSMUST00000119870 6189 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm29530-201ENSMUST00000187556 1956 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm17189-201ENSMUST00000163707 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Fn1-201ENSMUST00000055226 8315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cacnb4-206ENSMUST00000178799 7981 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Inca1-203ENSMUST00000108542 1080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm6370-201ENSMUST00000110611 1142 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cryba4-203ENSMUST00000112385 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Clic3-202ENSMUST00000114265 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 C330007P06Rik-203ENSMUST00000115249 1145 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pla2g10-202ENSMUST00000115807 964 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 4933406I18Rik-201ENSMUST00000124673 905 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm15276-201ENSMUST00000145953 498 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm6309-201ENSMUST00000174320 1154 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm2383-201ENSMUST00000181461 807 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm29199-201ENSMUST00000187766 775 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Fgfr3-ps-201ENSMUST00000195511 1137 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm33474-201ENSMUST00000199486 1231 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Odf4-201ENSMUST00000038932 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm10076-201ENSMUST00000073238 384 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cbx3-ps1-201ENSMUST00000091539 545 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Nwd2-201ENSMUST00000159584 8534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Nol10-201ENSMUST00000046011 3021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Adamts16-201ENSMUST00000080145 4981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm45643-201ENSMUST00000211364 1484 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rlbp1-202ENSMUST00000179243 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Sdf4-201ENSMUST00000050078 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Spert-202ENSMUST00000164082 1560 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 AC123857.2-201ENSMUST00000225756 1582 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Ash2l-204ENSMUST00000110610 2337 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cyp4f17-201ENSMUST00000165999 1693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Samd4-201ENSMUST00000022386 4564 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Sars-202ENSMUST00000102625 1866 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Ppp2r5c-204ENSMUST00000221074 1971 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 5330406M23Rik-201ENSMUST00000195672 2094 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Calcr-204ENSMUST00000170266 2175 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gtf2ird1-212ENSMUST00000200944 3133 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Actrt2-201ENSMUST00000060062 1435 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Pprc1-201ENSMUST00000062322 5205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Reep3-201ENSMUST00000020023 5430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Entpd5-203ENSMUST00000110272 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm35339-201ENSMUST00000208833 5090 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 BC055324-201ENSMUST00000045876 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Afmid-201ENSMUST00000073388 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Brd3-202ENSMUST00000077737 5272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Skap1-202ENSMUST00000100519 1100 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Spsb1-202ENSMUST00000105684 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm11595-201ENSMUST00000107440 1200 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Olfr239-201ENSMUST00000112165 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm13570-201ENSMUST00000140763 309 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Cox16-204ENSMUST00000166723 579 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rps13-201ENSMUST00000170953 589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Grp-203ENSMUST00000173985 952 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm19087-201ENSMUST00000191430 946 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gm42920-201ENSMUST00000196616 409 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 AC161537.1-201ENSMUST00000226199 1015 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 AC126253.1-202ENSMUST00000226732 835 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Psmb2-201ENSMUST00000030642 859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Fam96a-201ENSMUST00000034945 1240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Rnf7-201ENSMUST00000057500 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Taar7e-201ENSMUST00000092656 1077 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Ppm1b-204ENSMUST00000112307 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 H2-Ob-202ENSMUST00000167280 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Mast1-202ENSMUST00000119820 2078 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Plin3-201ENSMUST00000019726 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Clec11a-201ENSMUST00000004587 2978 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Mfap3l-202ENSMUST00000160719 6335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Slc7a4-202ENSMUST00000090165 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Chmp3Q9CQ10 Gtf2i-203ENSMUST00000111261 4381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
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