Protein–RNA interactions for Protein: Q99P87

Retn, Resistin, mousemouse

Predictions only

Length 114 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RetnQ99P87 Clpx-202ENSMUST00000113824 2809 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Rapgef3-217ENSMUST00000177352 3395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Myadm-203ENSMUST00000203328 1899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Tcf4-249ENSMUST00000202435 2427 ntTSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Stx3-203ENSMUST00000075304 2430 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 BC051537-201ENSMUST00000183290 1668 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Scml2-201ENSMUST00000019101 4842 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Hivep2-204ENSMUST00000187083 9268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Klhl38-201ENSMUST00000022985 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Islr-201ENSMUST00000041477 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Cdk11b-201ENSMUST00000067081 2595 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm15684-201ENSMUST00000160605 1814 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gtf2i-202ENSMUST00000082057 4375 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm5303-201ENSMUST00000117943 1252 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm15824-201ENSMUST00000119516 955 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm13185-201ENSMUST00000131044 944 ntTSL 3 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm17232-201ENSMUST00000164515 453 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Otx2os1-202ENSMUST00000183803 743 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm27892-201ENSMUST00000185017 106 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 1700120B22Rik-201ENSMUST00000054837 464 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Car5a-201ENSMUST00000057653 1249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Ttr-201ENSMUST00000075312 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Ifi27-202ENSMUST00000076702 828 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Trim46-202ENSMUST00000090924 2721 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm26577-201ENSMUST00000180680 2184 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Tiam1-204ENSMUST00000114124 7406 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Apbb1-201ENSMUST00000081165 2530 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Shroom1-202ENSMUST00000093114 2886 ntTSL 2 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Scml2-206ENSMUST00000112345 4847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Fbxl22-201ENSMUST00000056890 3935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm5912-201ENSMUST00000122282 1438 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Sh3bp2-202ENSMUST00000101316 3031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Phf23-209ENSMUST00000153684 1797 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Mettl1-201ENSMUST00000006915 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Lrrc30-201ENSMUST00000097290 1759 ntAPPRIS P1 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Otx2-201ENSMUST00000118578 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Igsf9-202ENSMUST00000111235 4205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm5385-201ENSMUST00000118988 1559 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Smtn-202ENSMUST00000020721 3335 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Tgfbr2-201ENSMUST00000035014 3476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Atad5-202ENSMUST00000108239 7266 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Slc7a11-205ENSMUST00000194462 2419 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Strada-201ENSMUST00000007444 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Zfp341-201ENSMUST00000081926 3299 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Ntsr1-202ENSMUST00000170448 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Slc45a4-207ENSMUST00000151288 7509 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 4732471J01Rik-203ENSMUST00000206300 1887 ntTSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm43860-201ENSMUST00000201742 2705 ntBASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Cpt1c-206ENSMUST00000212836 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.11□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Ccne2-201ENSMUST00000029866 3006 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Krt32-201ENSMUST00000107419 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 D830030K20Rik-201ENSMUST00000112797 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Dnmt3l-208ENSMUST00000151242 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Zc3hc1-210ENSMUST00000152391 1673 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Rfx6-204ENSMUST00000219364 2682 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Hspa5-201ENSMUST00000028222 3672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Crat-201ENSMUST00000028207 3833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Trim34b-201ENSMUST00000106847 1827 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Renbp-209ENSMUST00000155597 1310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Sgk1-203ENSMUST00000100036 2476 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Sgk1-201ENSMUST00000020145 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Add2-202ENSMUST00000203196 1970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Zfp853-203ENSMUST00000212715 3133 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Tom1l2-204ENSMUST00000095254 4940 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Slc7a6-201ENSMUST00000034378 3750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Kifc5b-201ENSMUST00000078961 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Cln8-201ENSMUST00000027554 6857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm13722-201ENSMUST00000117964 3066 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 2310035C23Rik-210ENSMUST00000190501 3852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Sgce-204ENSMUST00000115577 1776 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Cacna1e-207ENSMUST00000211821 6765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Pcdhb1-201ENSMUST00000052366 2588 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Pcif1-201ENSMUST00000041643 5772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Mab21l3-202ENSMUST00000118411 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 AC164441.2-201ENSMUST00000220818 2746 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Lmnb2-201ENSMUST00000057623 3531 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Btrc-202ENSMUST00000111936 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Selenoh-202ENSMUST00000102647 654 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Trav13d-2-201ENSMUST00000103596 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Trav13n-2-201ENSMUST00000103622 264 ntAPPRIS P1 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm15371-201ENSMUST00000117057 784 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Ankzf1-201ENSMUST00000127625 1167 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm13112-201ENSMUST00000138795 1258 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm6244-201ENSMUST00000178732 841 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm37047-201ENSMUST00000191992 533 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Lamtor1-202ENSMUST00000193465 661 ntTSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Sox2ot-216ENSMUST00000200092 767 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm6983-201ENSMUST00000214912 628 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Clps-201ENSMUST00000025062 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Fkbp2-201ENSMUST00000070878 642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Rhox2e-201ENSMUST00000072167 799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Alkbh7-202ENSMUST00000074141 736 ntTSL 1 (best) BASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Gm45532-201ENSMUST00000210342 3620 ntBASIC9.1□□□□□ -0.95
RetnQ99P87 Madd-204ENSMUST00000077941 5990 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC9.1□□□□□ -0.95
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.5 ms