Protein–RNA interactions for Protein: Q99NF2

Nsmf, NMDA receptor synaptonuclear signaling and neuronal migration factor, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NsmfQ99NF2 Olfr398-201ENSMUST00000053874 945 ntAPPRIS P1 BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Trp53i11-202ENSMUST00000111266 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Apaf1-207ENSMUST00000161987 2710 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Nup88-201ENSMUST00000035283 2450 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Krba1-203ENSMUST00000114571 6695 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Sp4-203ENSMUST00000222314 2677 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Twf1-201ENSMUST00000023087 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gtf2ird1-201ENSMUST00000073161 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Pdp1-205ENSMUST00000108301 2635 ntTSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Kdelr1-201ENSMUST00000002855 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Galnt6-203ENSMUST00000161514 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.94□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gspt1-205ENSMUST00000167571 3716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Tom1-201ENSMUST00000078847 1769 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Zfp142-203ENSMUST00000113737 7473 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm18626-201ENSMUST00000221512 1409 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Pitpnb-201ENSMUST00000086635 2761 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ikzf1-201ENSMUST00000018798 1542 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gprc5a-201ENSMUST00000050104 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ints7-201ENSMUST00000045450 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mamdc4-202ENSMUST00000114223 3998 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Map10-201ENSMUST00000053078 3542 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Kcnk13-201ENSMUST00000049788 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Cux2-202ENSMUST00000111752 8784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Fgfr3-209ENSMUST00000164207 4150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ighv5-4-201ENSMUST00000103444 425 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm6890-201ENSMUST00000114117 776 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm14051-201ENSMUST00000131603 377 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm13115-201ENSMUST00000156438 620 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm24749-201ENSMUST00000157838 343 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rps28-202ENSMUST00000166693 271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Nat8f7-202ENSMUST00000179613 686 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ip6k2-202ENSMUST00000192028 1199 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm32999-201ENSMUST00000192693 562 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 AC164573.1-201ENSMUST00000218616 963 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Elovl1-202ENSMUST00000067896 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rpl18-201ENSMUST00000072503 679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 C530008M17Rik-203ENSMUST00000120818 1378 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Stk25-201ENSMUST00000027498 4249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ttc34-201ENSMUST00000050220 3200 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Sesn3-204ENSMUST00000208222 9125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rgs6-209ENSMUST00000186848 1472 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Padi2-201ENSMUST00000030765 4774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Nisch-213ENSMUST00000168206 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Tor1aip2-207ENSMUST00000128941 2925 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Micalcl-201ENSMUST00000033033 2259 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ggnbp1-203ENSMUST00000133257 5012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Zfp365-201ENSMUST00000064656 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Trpv4-204ENSMUST00000112222 2475 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ankrd34a-201ENSMUST00000058943 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Synj2-202ENSMUST00000080283 4793 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rnf14-202ENSMUST00000170811 2886 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Urgcp-203ENSMUST00000118076 4208 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 A230072I06Rik-201ENSMUST00000098935 1839 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 D330041H03Rik-205ENSMUST00000181014 1903 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Dnajb5-204ENSMUST00000107973 2300 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Nr4a3-201ENSMUST00000030025 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Mknk1-201ENSMUST00000019677 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm38346-201ENSMUST00000192379 2639 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rbpj-207ENSMUST00000201883 4961 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Phf13-201ENSMUST00000055688 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ncmap-202ENSMUST00000105857 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm14064-201ENSMUST00000134833 727 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Nsd3-203ENSMUST00000136107 3818 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Ccdc28a-203ENSMUST00000173243 590 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Tnnt1-213ENSMUST00000178163 934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 2010010A06Rik-201ENSMUST00000185628 258 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm18304-201ENSMUST00000189162 546 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm7003-201ENSMUST00000195089 312 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm45598-202ENSMUST00000210719 986 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Acbd5-208ENSMUST00000226571 3802 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Prr13-201ENSMUST00000023810 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 2410015M20Rik-201ENSMUST00000052832 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Prr15l-202ENSMUST00000062172 1242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Olfr450-201ENSMUST00000067503 933 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Asb18-202ENSMUST00000097656 788 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Irx3os-203ENSMUST00000133528 1354 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Acp5-203ENSMUST00000165735 1376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Vmp1-201ENSMUST00000018315 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Prss36-201ENSMUST00000094026 3061 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rab15-201ENSMUST00000021459 3158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Tcf25-201ENSMUST00000057934 2738 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm26551-201ENSMUST00000181262 2432 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Zfp207-206ENSMUST00000165565 2311 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Galns-203ENSMUST00000212319 2111 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Rgs11-202ENSMUST00000122058 2005 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Itgb4-202ENSMUST00000068981 5584 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Hsd3b3-203ENSMUST00000107018 1443 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Retreg1-206ENSMUST00000228306 1430 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 AC079680.2-201ENSMUST00000219181 1306 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm26599-201ENSMUST00000180590 3189 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Il12rb1-201ENSMUST00000000808 2873 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Stard8-201ENSMUST00000036606 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Kctd11-201ENSMUST00000050555 3146 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Plcxd3-201ENSMUST00000061925 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
NsmfQ99NF2 Gm43858-201ENSMUST00000199418 1778 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.7 ms