Protein–RNA interactions for Protein: Q99MV7

Rnf17, RING finger protein 17, mousemouse

Predictions only

Length 1,640 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf17Q99MV7 Catsper3-201ENSMUST00000021961 1330 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Bin3-201ENSMUST00000022680 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Npas3-201ENSMUST00000101432 5879 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Rgl1-201ENSMUST00000027760 4572 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Bean1-206ENSMUST00000213077 1373 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Cacna1b-201ENSMUST00000041342 6984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 AC129931.1-201ENSMUST00000228865 1861 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Dnaja2-201ENSMUST00000034138 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Tle6-210ENSMUST00000142948 1961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Txlng-203ENSMUST00000112315 2525 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Cpsf7-201ENSMUST00000038379 3604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 4930563E18Rik-201ENSMUST00000180948 1553 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Zkscan3-207ENSMUST00000223831 2101 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Gpr45-203ENSMUST00000179766 3776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Ccndbp1-203ENSMUST00000099489 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Ip6k3-201ENSMUST00000025046 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Tcf3-208ENSMUST00000105344 2946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Aaas-201ENSMUST00000041208 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Trav11-201ENSMUST00000103585 343 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Trav11d-201ENSMUST00000103648 342 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Aknaos-201ENSMUST00000144095 1104 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Trav11n-201ENSMUST00000200113 343 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Cabcoco1-201ENSMUST00000020103 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Gm21221-201ENSMUST00000202876 1073 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Gm44506-201ENSMUST00000206278 965 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Cyfip2-205ENSMUST00000165599 6659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Lysmd4-201ENSMUST00000058771 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Spdye4a-203ENSMUST00000195900 1496 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Tbc1d8-201ENSMUST00000054462 4451 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Tmem237-205ENSMUST00000186794 1533 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Pex12-202ENSMUST00000108146 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Trim26-201ENSMUST00000053434 3198 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Tfdp1-201ENSMUST00000170909 1700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 F630040K05Rik-202ENSMUST00000180558 2633 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Capn3-201ENSMUST00000028748 2606 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Rnf17Q99MV7 Vmac-202ENSMUST00000164907 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Smyd1-203ENSMUST00000114188 2064 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Atg16l1-201ENSMUST00000027512 3130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Fam84b-201ENSMUST00000100635 5565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Wnk2-205ENSMUST00000110097 6882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Wnk2-203ENSMUST00000091623 6897 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Capn9-201ENSMUST00000093033 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm23272-201ENSMUST00000104053 129 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Tcf7l2-204ENSMUST00000111649 982 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Cnfn-202ENSMUST00000167591 698 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm8451-201ENSMUST00000170338 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm20536-201ENSMUST00000172588 406 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm9136-201ENSMUST00000193368 454 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Fxyd4-202ENSMUST00000203066 522 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm8342-201ENSMUST00000209839 757 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 AC164087.2-201ENSMUST00000216206 1072 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Cby1-201ENSMUST00000023064 1119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Tex35-201ENSMUST00000027884 909 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm7536-201ENSMUST00000077389 444 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm5453-201ENSMUST00000080866 447 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Tbc1d22bos-202ENSMUST00000163069 1349 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Mob1b-201ENSMUST00000006424 2705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Serinc2-202ENSMUST00000120126 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm37912-201ENSMUST00000191895 3076 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Srsf5-205ENSMUST00000110356 1568 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Mpped1-201ENSMUST00000046168 3265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Zkscan17-201ENSMUST00000013262 4064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Hdgfl2-212ENSMUST00000226053 2270 ntAPPRIS P2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Atg7-210ENSMUST00000182793 2459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Tmem63b-201ENSMUST00000113523 3284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Rpl23-201ENSMUST00000103146 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 1700080O16Rik-202ENSMUST00000114866 1232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm9166-201ENSMUST00000120293 561 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm10169-201ENSMUST00000121822 348 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 5430405H02Rik-201ENSMUST00000153616 1431 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 2900041M22Rik-201ENSMUST00000155384 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm22146-201ENSMUST00000157397 288 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 N4bp2l1-201ENSMUST00000016279 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Ighv1-76-201ENSMUST00000169155 294 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Ighv1-62-1-202ENSMUST00000171270 90 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Cfap73-201ENSMUST00000177908 921 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm43552-201ENSMUST00000196121 365 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Necap1-201ENSMUST00000032477 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 C8g-202ENSMUST00000040042 1150 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Pars2-201ENSMUST00000058905 2191 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Ctbs-202ENSMUST00000061937 2892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Lrrc74b-202ENSMUST00000065125 1539 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Parp16-201ENSMUST00000069000 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Gm5513-201ENSMUST00000072982 1218 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Olfr1339-201ENSMUST00000094832 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Cux1-206ENSMUST00000176172 4882 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Slmap-212ENSMUST00000139075 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Ptprn2-201ENSMUST00000070733 3201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Pdyn-201ENSMUST00000028883 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 C1qtnf9-201ENSMUST00000025940 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Tpm1-201ENSMUST00000030185 1797 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 4933406P04Rik-201ENSMUST00000092680 1789 ntBASIC18■□□□□ 0.47
Rnf17Q99MV7 Rnh1-204ENSMUST00000210314 1658 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 40 ms